第二套房住房公积金贷款利率为五年期以下3.025%，五年期以上3.575%。第二套房公积金贷款利率是第一套房基准利率的1.1倍。
此外，如果要认定为二套房，需符合以下条件：
1、对于借款人购房时查出名下现有全款购买的房屋，在未出售的情况下，再贷款购房仍会被认定为第二套房；
2、对于借款人之前曾贷款购房，即使是贷款购置的房产已结清出售，再贷款时同样会被认定为第二套房。
根据二套房政策，如果是被认定为第二套房的购房者，那么再贷款时一律按照首付50%、利率上浮1.1倍来执行。
《住房公积金管理条例》第二十四条
职工有下列情形之一的，可以提取职工住房公积金账户内的存储余额：
（一）购买、建造、翻建、大修自住住房的；
（二）离休、退休的；
（三）完全丧失劳动能力，并与单位终止劳动关系的；
（四）出境定居的；
（五）偿还购房贷款本息的；
（六）房租超出家庭工资收入的规定比例的。
