2000年登记结婚时男方年龄不够，在镇上办的，手写的结婚证，找关系把年龄填大了三岁，后来档案统一到县里民政局婚姻登记了。结果档案也查不到了，那个结婚证是否有效

涉外婚姻如何登记结婚的问题有明确规定。
《婚姻登记条例》
第二章　结婚登记
第四条　内地居民结婚，男女双方应当共同到一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关办理结婚登记。
中国公民同外国人在中国内地结婚的，内地居民同香港居民、澳门居民、台湾居民、华侨在中国内地结婚的，男女双方应当共同到内地居民常住户口所在地的婚姻登记机关办理结婚登记。

我国婚姻法第8条规定 ：“要求结婚的男女双方必须亲自到婚姻登记机关进行结婚登记。符合本法规定的，予以登记，发给结婚证，即确立夫妻关系”。这一规定说明：
（1）进行登记是结婚必经的法定程序。
只有办理结婚登记，才能成立合法的婚姻关系，双方的婚姻关系才发生法律效力，才会受到国家和法律的承认和保护，不登记的婚姻是违法婚姻。
（2）进行登记是结婚唯一的法定程序。
（3）实行结婚登记制度，是严格执行婚姻法，保护婚姻关系的需要。
（4）实行结婚登记制度，可以提高当事人的法制观念 ，进法制宣传教育和社会主义道德教育，减少纠纷，维护安定团结，保护当事人的合法权益。
实行结婚登记，可给婚姻当事人以法制宣传和道德教育，预防和减少婚姻、家庭纠纷，为以后的婚姻家庭生活奠定良好的基础;同时，实行结婚登记，还可以给争取婚姻自由的当事人及时地提供法律援助，保障当事人正当的婚姻要求，及时拯救因无知或受骗或受威胁而陷入不幸婚姻旋涡的婚姻当事人。
（5）防止和惩治违法婚姻行为。
通过结婚登记，国家工作人员可以发现违法的婚姻行为，对违法婚姻当事人进行批评教育，及时纠正违法婚姻行为，并对严重违法者施以相应的法律惩治措施。
（6）进行结婚登记，是实现社会主义婚姻制度的保障。

根据《婚姻登记条例》第六条规定，办理结婚登记的当事人有下列五项情形之一的，婚姻登记机关不予登记：
（一） 未到法定结婚年龄的；
（二）非双方自愿的；
（三）一方或者双方已有配偶的；
（四）属于直系血亲或者三代以内旁系血亲的；
（五） 患有医学上认为不应当结婚的疾病的。