年度全勤和年终奖都是按自然年核算的，但是公司以规定全勤奖随3月份工资和年终双薪也就是2013年4月10号一次核算和发放的为由拒绝支付，我从未见过此规定，员工手册和合同上都没有此类说明，据说公司也没上税，?我辛辛苦苦工作一年半，结果这些该得的凭什么不给发放，实在是不合情理！

年终奖是公司对员工一年工作的肯定和激励。一般公司会根据公司的盈利情况制度年终奖的发放标准和方式。合同中要不要载明年终奖发放的条件、数额、时间等具体事宜，公司有自主权。
劳动者也可以在签订合同时与公司进行协商。许多老板觉得将发放年终奖的权限掌握在自己手中更放心，因此不愿在合同中载明。

一、年终奖可否不和当月工资一起计算个税　　
1、年终奖金应纳税额　　年度奖金的个人所得税适用的税率：年终奖金总额/12后再对应适用税率　　年终奖应纳税额=年终奖金总额×年终奖适用税率-速算扣除数　　
2、工资个税的计算公式　　应纳税额=(工资薪金所得-“五险一金”-扣除数)×适用税率-速算扣除数　　
3、个税免征额是3500，使用超额累进税率的计算方法　　缴税=全月应纳税所得额*税率-速算扣除数　　实发工资=应发工资-四金-缴税。　　全月应纳税所得额=(应发工资-四金)-3500　　
4、扣除标准　　个税按3500元/月的起征标准算　　
二、个人所得税税率　　个人所得税根据不同的征税项目，分别规定了三种不同的税率：　　
1.工资、薪金所得，适用7级超额累进税率，按月应纳税所得额计算征税。该税率按个人月工资、薪金应税所得额划分级距，最高一级为45%，最低一级为3%，共7级。　　
2.个体工商户的生产、经营所得和对企事业单位适用5级超额累进税率。适用按年计算、分月预缴税款的个体工商户的生产、经营所得和对企事业单位的承包经营、承租经营的全年应纳税所得额划分级距，最低一级为5%，最高一级为35%，共5级。　　
3.比例税率。对个人的稿酬所得，劳务报酬所得，特许权使用费所得，利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得，偶然所得和其他所得，按次计算征收个人所得税，适用20%的比例税率。其中，对稿酬所得适用20%的比例税率，并按应纳税额减征30%;对劳务报酬所得一次性收入畸高的，除按20%征税外，应纳税所得额超过2万元至5万元的部分，依照税法规定计算应纳税额后再按照应纳税额加征五成;超过5万元的部分，加征十成。

发放工资的当月，计算应交个人所得税。如果当月发放多次，应该合并计税，也就是第二次、第三次、第四次与前面首先合并计税，然后补差。个税不是计提的时候产生的，是发放的时候计算的。
因此即便计提的时候没有考虑到多次发放产生的税费，次月也必须按照税法申报。税法是不管你是否按月发放工资的，税法只关注每月发放的合计数是否符合申报纳税数。