您好，我在一家民营医院后勤工作。2018年8月份入职，现还在试用期，因我有事请假未批，就旷工去办理自己的事情（加周末共计6天）。回来后经理不要我上班了，还要去我写辞职报告，我没办法写了辞职报告，现在办理手续，医院要我交4000元的违约金，说是当初填了三方协议，要缴纳违约金，我现在该怎么办？

一、劳动者提出解除劳动关系是不需要用人单位同意的。劳动者提出解除劳动关系的方式分以下三种情况：　　
1、正常辞职的情况。劳动者依据《劳动合同法》三十七条的规定，劳动者提前30天书面提出辞职，不需要用人单位批准第31天就可以离职。其中，试用期提前3天书面提出；用人单位有义务结清工资并办理离职手续。　　
2、即时辞职，即所谓的快辞。用人单位存在《劳动合同法》第三十八条的情况（例如拖欠劳动者工资和未缴纳社会保险等情况），劳动者书面提出解除劳动关系后可以立即走人不需要用人单位的批准，并可以要求用人单位支付剩余的工资、经济补偿金（每工作1年支付1个月工资）及办理离职手续等；　　　　
3、劳动者违法辞职的情况。没有提前30天提出离职，用人单位也不存在《劳动合同法》第三十八条的情况，劳动者直接提交辞职信就走人，这个时候就是劳动者违法。如果给用人单位造成的直接经济损失的（例如招聘该劳动者产生的费用），用人单位可以要求劳动者承担。　　
二、劳动者可以通过快递或挂号信邮寄的方式给用人单位送达解除劳动关系的通知（也就是通俗说的辞职信、辞职报告），这样便于保留证据。用人单位不支付劳动者工资或不为劳动者办理离职手续，可以通过申请劳动仲裁解决；　　《劳动合同法》第三十七条　劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。

按实际情况及相关的法律规定，只有约定的违约金符合法律规定的，才受到法律保护，否则可以拒绝承担违约金。
　　《中华人民共和国劳动合同法》　第二十二条　用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。
　　劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
　　用人单位与劳动者约定服务期的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期期间的劳动报酬。
　　第二十三条　用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。
　　对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。
劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
　　第二十四条　竞业限制的人员限于用人单位的高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员。竞业限制的范围、地域、期限由用人单位与劳动者约定，竞业限制的约定不得违反法律、法规的规定。
　　在解除或者终止劳动合同后，前款规定的人员到与本单位生产或者经营同类产品、从事同类业务的有竞争关系的其他用人单位，或者自己开业生产或者经营同类产品、从事同类业务的竞业限制期限，不得超过二年。

根据我国《劳动合同法》第37条的规定：劳动者提前30日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。
因此，你只要提前30天向你的公司提出书面申请就行，而且也不用支付违约金。
为了避免再次发生你现在的这种情况，你可以保留下你提交辞职报告的证据，30天后公司还不允许你辞职，首先可以让你单位的工会出面调节，不行的话你可以申请劳动争议仲裁委员会出面解决，再不行，直接提起讼诉。
当然啦，这些措施没有先后的顺序，只是为了让你能够以最少的代价解决这件事情。