我们所现在与一个软件公司合作开发一个软件，在签署合同时，软件公司声明，版权归他们所有，而我们这边的人也参与了软件开发，如果我们想申请软件著作权，应该怎么办？

软件著作权即软件开发完成之日起就自动产生，登记并不是权利产生的必要条件。软件著作权登记申请是指著作权人向中国版权保护中心提出申请，由中国版权保护中心审核并发出软件著作权登记证书。
申请软件著作权 条件有： 软件著作权人主体资格证明，主体资格具体有：自然人、法人或者其他组织。 软件著作权人自主开发软件证明即软件著作权的权利归属证明和软件产品的相关资料（具体有：软件的源程序及文档；软件的名称及版本号、开发完成时间、发表时间；软件运行环境（指软件运行的硬件和软件环境）；软件开发使用的编程语言的名称及版本号、源程序总行数；软件的主要功能、用途和技术特点作简要说明。
）

软件著作权申请资料如下：
1、按要求填写《计算机软件著作权登记申请表》一份
2、申请者身份证明复印件加盖公章一份，注：
3、源程序一份，要求：
（1）按前、后各连续30页,共60页(不足60页全部提交），源程序要求每页不少于50行(结束页除外)A4纸单面黑白打印；
（2）源程序应在页眉上标注相应的软件名称和版本号，右上角应标注页码，页脚要注明著作权人全称；
4、文档(如:用户手册、设计说明书、使用说明书等任选一种)一份，要求：
（1）按前、后各连续30页,共60页(不足60页全部提交），文档要求每页不少于35行(结束页除外)A4纸单面黑白打印；
（2）文档应在页眉上标注相应的软件名称和版本号，右上角应标注页码，页脚要注明著作权人全称；
5、填写《代理委托书》一份
6、如软件是在linux平台上以GCC开发的,需提交：《GPL声明》一份
7、个人申请者需下载并填写《非职务软件开发保证书》一份
8、其他软件权属证明文件（一般不需要，只有在委托开发等特殊情况下需要提供）

软件著作权申请资料： 《计算机软件著作权登记办法》　 第七条 申请登记的软件应是独立开发的，或者经原著作权人许可对原有软件修改后形成的在功能或者性能方面有重要改进的软件。 　　第八条 合作开发的软件进行著作权登记的，可以由全体著作权人协商确定一名著作权人作为代表办理。著作权人协商不一致的，任何著作权人均可在不损害其他著作权人利益的前提下申请登记，但应当注明其他著作权人。 　　第九条 申请软件著作权登记的，应当向中国版权保护中心提交以下材料： 　　
（一）按要求填写的软件著作权登记申请表； 　　
（二）软件的鉴别材料； 　　
（三）相关的证明文件。 　　第十条 软件的鉴别材料包括程序和文档的鉴别材料。 　　程序和文档的鉴别材料应当由源程序和任何一种文档前、后各连续30页组成。整个程序和文档不到60页的，应当提交整个源程序和文档。除特定情况外，程序每页不少于50行，文档每页不少于30行。 　　第十一条 申请软件著作权登记的，应当提交以下主要证明文件： 　　
（一）自然人、法人或者其他组织的身份证明； 　　
（二）有著作权归属书面合同或者项目任务书的，应当提交合同或者项目任务书； 　　
（三）经原软件著作权人许可，在原有软件上开发的软件，应当提交原著作权人的许可证明； 　　
（四）权利继承人、受让人或者承受人，提交权利继承、受让或者承受的证明。