土地确权实测面积多于承包合同面积，村里要按原地亩数确权，但一部分村民不同意，要按实测确权，怎么办？

农村土地承包合同纠纷有诉讼时效的。现在对农村土地承包合同的性质是分歧的，有的认为是民事合同，有的认为是行政合同。因为村委会不是行政机构，因此村民与村委会签订的合同本身应属民事合同。
无论是哪种类型的合同，民事诉讼与行政诉讼都有有关时效的规定。
如果承包合同是村民间的土地经营权流转合同，那无争议的属于民事合同，当然也有时效的限制。

签订农村土地承包合同要注意什么　　
一、土地纠纷必须处理到位，严禁回避矛盾。在土地承包纠纷未彻底处理前，存在土地承包纠纷的村民小组的所有农户都不能签订合同，以免堵死土地承包纠纷调处的空间。　　
二、签订合同必须阳光操作，严禁闭门造车。凡是农户耕地台帐登记没有入户核实并经农户签字确认的村组，签订合同要一律登门入户。　　
三、农户签字必须真实可靠，严禁随意代签。在签订合同过程中，要充分宣传依法完善农村土地二轮延包政策，尊重农民群众的知情权和参与权，使农户签字代表农户的真实意愿。　　
四、合同填写必须整洁规范，严禁自作主张。下列内容必须统一规范：　　
1、合同封面上的“合同编号”和“鉴证编号”为同一编号;　　
2、“承包方代表姓名”要与身份证一致;　　
3、“承包土地人口”为农户现有人口;　　
4、“土地承包经营权共有人”与“承包方代表关系”要明确;　　
5、“承包期限”起始日期为签订合同的现时日期;　　
6、“承包方签章”如无私章的，应由承包方签名并按手印确认;　　
7、“承包土地地块情况”长、宽可以不填，面积一定要填，地块“田界”必须准确具体，台账登记不准确具体的应予纠正;　　
8、“地块地类”只分水田、旱地两类;　　
9、“承包地附着物情况”要实事求是，不能漏填错填;　　
10、“鉴证机关签章”必须在对签订合同进行认真审查后进行，不符合质量要求的不能签章。

土地确权机关是依法有权确定土地所有权和使用权归属的行政机关。依照我国《土地管理法》第十六条的规定，确权的权利主体为乡级或县级以上人民政府，也就是说只有乡级或县级以上人民政府才具有确认所有权和使用权的权力。
主管是指确定土地所有权和使用权的具体承办部门。土地管理部门做为人民政府的职能部门，具体承办确权工作，对确权的意见和建议，要报同级人民政府作出决定。