建筑合同工期为一年，例如2018年3月至2019年3月。先预付百分之二十工程款，工程按期完工。剩余工程款在三年以后支付完，且施工单位在此期间不起诉索赔的情况下，工程合同中是否可以写明三年以后付清工程款，这样是否违法?

还是建设工程施工合同纠纷。不当得利是双方没有法律关系。而问题介绍是双方有法律关系，只是多付款了，故应以建设工程施工合同纠纷起诉。一般原告涉及已付款、代付款、损失的举证，还涉及应付款 举示。
相互品跌就知道诉讼请求是否成立。还有原告要提出合同效力的主张，如果主张效力不正确，法院会释明。一般释明后，建议按法院释明的合同效力改变合同效力的主张。

第十条 工程设计变更价款调整
　　
(一)施工中发生工程变更，承包人按照经发包人认可的变更设计文件，进行变更施工，其中，政府投资项目重大变更，需按基本建设程序报批后方可施工。
　　
(二)在工程设计变更确定后14日内，设计变更涉及工程价款调整的，由承包人向发包人提出，经发包人审核同意后调整合同价款。变更合同价款按下列方法进行：
　　1．合同中已有适用于变更工程的价格，按合同已有的价格变更合同价款；
　　2．合同中只有类似于变更工程的价格，可以参照类似价格变更合同价款；
　　3．合同中没有适用或类似于变更工程的价格，由承包人或发包人提出适当的变更价格，经对方确认后执行。如双方不能达成一致的，双方可提请工程所在地工程造价管理机构进行咨询或按合同约定的争议或纠纷解决程序办理。
　　
(三)工程设计变更确定后14日内，如承包人未提出变更工程价款报告，则发包人可根据所掌握的资料决定是否调整合同价款和调整的具体金额。重大工程变更涉及工程价款变更报告和确认的时限由发承包双方协商确定。