我的三方协议，三方我已经签了，公司也签了，但是学校部分还未签，补充协议有违约1000元，到时候不去工作算违约吗？

违约金本身就不合法，实习过程是对学生与公司上方的考察，不存在违约的情形。因为三方协议是一种特殊的合同，和一般劳动合同处理原则是不一样的。三方协议是《全国普通高等学校毕业生就业协议书》的简称，它是明确毕业生、用人单位、学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式，能解决应届毕业生户籍、档案、保险、公积金等一系列相关问题。
协议在毕业生到单位报到、用人单位正式接收后自行终止。三方协议一旦签署，就意味着大学生第一份工作就基本确定，因此，应届毕业生要特别注意签约事项。高校就业办一位老师说，大学生签三方协议前，要认真查看用人单位的隶属，国家机关、事业单位、国有企业一般都有人事接收权。
民营企业、外资企业则需要经过人事局或人才交流中心的审批才能招收职工，协议书上要签署他们的意见才能有效。应届毕业生还要对不同地方人事主管部门的特殊规定有所了解。三方就业协议书不同于劳动合同。
首先，三方就业协议书是国家教育部统一印制的，主要是明确三方的基本情况及要求。三方就业协议书制定的依据是国家关于高校毕业生就业的法规和规定，有效期为：自签约日起至毕业生到用人单位报到止的这一段时间。
而劳动合同是受《劳动法》和《合同法》的限定和保护，有些用人单位如许多外企在确定录用时（注：在到用人单位报到前），就同时要求和毕业生签订一份类似劳动合同的协议；而更多的用人单位则要求先签“就业意向书”，毕业生报到后再签订劳动合同。
其次，就业协议是三方合同，它涉及学校、用人单位、学生等三方面，三方相互关联但彼此独立；而劳动合同是双方合同，它由劳动者和用人单位两方的权利、义务构成。第三，毕业生签订就业协议时仍然是学生身份，但是签订劳动合同时应当是劳动者身份。
劳动合同一经签订，就业协议的效力应当丧失。如果劳动合同与三方协议附件内容矛盾，以劳动合同为准。以上就是三方违约金怎么算这个问题的具体回答了

1、三方协议一定要十分认真仔细的填写，如果写错了将需要重新申请且申请周期比较长，一般都是是10到15天，可能会对自己的签约产生不良影响。因此建议大家先在草稿纸上模拟一遍来避免出错。
2、拿到三方协议后填写乙方(毕业生)的各项内容时必须要填写完整，“毕业院校”与“专业名称”一定要记得填写其全称，也就是说要与学校教务处里的专业名称相一致，不该写简称
3、个人信息填写好后就交给单位填写“甲方(用人单位)”信息。填写好后，在下部“用人单位或单位人事部门签章”处加盖单位公章，右侧“用人单位上级主管部门或所属地人事局签章”也必须加盖，若此章缺失，则可能造成毕业后落户、档案转接的困难
4、用人单位名称是否与单位的有效印鉴名称一致
5、以上信息填写好后拿到学院学工办和学校签学校的章和意见。学校签好，三份协议按照协议书右侧边上由各方保存。

在双方自愿且符合劳动法要求前提下，签订的补充协议，与劳动合同享有同等法律效力。一旦双方签字认同，如果出现违约情况，另一方都可以用此为依据，向劳动监管部门申诉维权。　　严格而言，合同补充协议是对原合同未尽事宜，或者合同履行过程新发生的情况而另外进行的约定。与合同的变更协议不同，但实务中订立的以“补充协议”为名的协议，其实质内容却常是合同的补充并有变更。因此，在签订时要特别注意以下三个问题：
1、补充协议的当事人应当与原合同当事人严格一致；
2、补充协议的形式应当与原合同一样完备；严格防止与原合同发生内容矛盾。