因为我违反了我和单位签的劳动合同，单位想跟我解除劳动合同，但是我现在在医疗期，单位可以解除跟我的劳动合同吗

申请劳动仲裁并不意味着跟公司解除劳动合同。申请劳动争议仲裁，是仲裁某个劳动争议事项，如拖欠工资、不付加班费等，但在仲裁过程中你仍要继续上班工作。一旦仲裁裁定单位应发放工资、补偿加班费等后，仲裁就结束了。
至于你和单位的劳动合同是不以仲裁而影响。

医疗期，如果单位拟解除劳动合同，其依据是《劳动合同法》第四十条“有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同：
(一)劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的”。　　职工在医疗期满后，是否还能从事原工作或单位另行安排的工作工作。如果不能再从事原工作或另行安排的其他工作(需经劳动鉴定委员会确认)，则单位可以解除与其的劳动合同，同时支付经济补偿金。　　根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。　　职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予3个月到24个月的医疗期：　　
1、实际工作年限10年以下的：在本单位工作年限5年以下的为3个月;5年以上的为6个月。　　
2、实际工作年限10年以上的：在本单位工作年限5年以下的为6个月，5年以上10年以下的为9个月;10年以上15年以下的为12个月;15年以上20年以下的为18个月;20年以上的为24个月

《劳动合同法》第四十九条规定“国家采取措施，建立健全劳动者社会保险关系跨地区转移接续制度。”　　《劳动合同法》第五十条规定“用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。”　　劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。　　用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。　　《劳动法》对劳动合同解除或终止后手续办理没有作出明确规定。有关劳动合同解除或终止手续办理散见在劳动部一些规章中。劳动部1992年《企业职工档案管理工作规定》(劳动部劳力字[1999]33号)第18条规定，解除或终止劳动合同，用人单位应在1个月内将职工档案交其新的工作单位或者其户口所在地街道劳动部门。劳动部1996年颁布的《关于实行劳动合同制度若干问题的通知》规定，在劳动者履行了有关义务终止、解除劳动合同时，用人单位应当出具终止、解除劳动合同证明书，作为该劳动者按规定享受失业保险待遇和失业登记、求职登记的凭证。证明书应写明劳动合同期限、终止或解除的日期，所担任的工作。如果劳动者要求，用人单位可以在证明中客观地说明解除劳动合同的原因。上述这些规定并不完善，对于劳动合同解除或终止时，用人单位和劳动者在工作交接过程中双方享有的权利和义务、劳动者档案移交和社会保险手续转移期限以及当事人不履行法律规定义务应当承担的法律责任等都没有明确规定。因此，《劳动合同法》在以下几个方面加以了完善：　　
(1)明确提出，要求国家采取措施，让劳动者基本养老保险个人账户随劳动者在全国范围内流动。这样，一旦劳动合同解除或终止，劳动者基本养老保险个人账户可以随劳动者转移到新工作单位和新的地区，养老保险利益不受损失。　　
(2)不仅明确规定了用人单位在劳动合同解除或终止后负有出具证明、转移档案和社或保险手续，而且设定期限的要求。　　
(3)明确规定了劳动者要按约定办理交接的义务。　　
(4)明确规定了用人单位妥善保管有关劳动合同文本，接受检查监督的义务。