我们有一个三岁的女儿，也分居两年了现在孩子跟他过，我想离婚怎么办？

夫妻一方不愿离婚，或者双方无法达成离婚协议，可以由主张离婚一方到法院起诉离婚。　　只要有夫妻感情破裂的证据，在法院调解无效前提下，法院会判决准予离婚。　　两位离婚时，需要本着孩子最大利益出发，自行协议孩子的抚养权归属。规定是孩子2岁以内属于哺乳期，归女方直接抚养。孩子超过十周岁需要征求孩子意见。　　如果两位无法达成孩子抚养权归属的协议，可以到法院起诉解决。　　《婚姻法》规定：　第三十二条男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。　　第三十六条父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养和教育的权利和义务。离婚后，哺乳期内的子女，以随哺乳的母亲抚养为原则。哺乳期后的子女，如双方因抚养问题发生争执不能达成协议时，由人民法院根据子女的权益和双方的具体情况判决。第三十七条离婚后，一方抚养的子女，另一方应负担必要的生活费和教育费的一部或全部，负担费用的多少和期限的长短，由双方协议；协议不成时，由人民法院判决。关于子女生活费和教育费的协议或判决，不妨碍子女在必要时向父母任何一方提出超过协议或判决原定数额的合理要求。　　《最高人民法院关于人民法院审理离婚案件处理子女抚养问题的若干具体意见》规定：　　
1、两周岁以下的子女，一般随母方生活。母方有下列情形之一的，可随父方生活：　　
（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；　　
（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；　　
（3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。　　
2、父母双方协议两周岁以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许。　　
3、对两周岁以上未成年的子女，父方和母方均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑：　　
（1）已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的；　　
（2）子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的；　　
（3）无其他子女，而另一方有其他子女的；　　
（4）子女随其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的。　　
4、父方与母方抚养子女的条件基本相同，双方均要求子女与其共同生活，但子女单独随祖父母或外祖父母共同生活多年，且祖父母或外祖父母要求并且有能力帮助子女照顾孙子女或外孙子女的，可作为子女随父或母生活的优先条件予以考虑。　　
5、父母双方对十周岁以上的未成年子女随父或随母生活发生争执的，应考虑该子女的意见。　　
6、在有利于保护子女利益的前提下，父母双方协议轮流抚养子女的，可予准许。　　
7、子女抚育费的数额，可根据子女的实际需要、父母双方的负担能力和当地的实际生活水平确定。　　有固定收入的，抚育费一般可按其月总收入的百分之二十至三十的比例给付。负担两个以上子女抚育费的，比例可适当提高，但一般不得超过月总收入的百分之五十。　　无固定收入的，抚育费的数额可依据当年总收入或同行业平均收入，参照上述比例确定。　　有特殊情况的，可适当提高或降低上述比例。　　
8、抚育费应定期给付，有条件的可一次性给付。　　
9、对一方无经济收入或者下落不明的，可用其财物折抵子女抚育费。　　
10、父母双方可以协议子女随一方生活并由抚养方负担子女全部抚育费。但经查实，抚养方的抚养能力明显不能保障子女所需费用，影响子女健康成长的，不予准许。　　
11、抚育费的给付期限，一般至子女十八周岁为止。　　十六周岁以上不满十八周岁，以其劳动收入为主要生活来源，并能维持当地一般生活水平的，父母可停止给付抚育费。　　
12、尚未独立生活的成年子女有下列情形之一，父母又有给付能力的，仍应负担必要的抚育费：　　
（1）丧失劳动能力或虽未完全丧失劳动能力，但其收入不足以维持生活的；　　
（2）尚在校就读的；　　
（3）确无独立生活能力和条件的。

夫妻双方想离婚，可以协议离婚，也可诉讼离婚。
对于婚姻债务，《婚姻法》第32条规定：“离婚时，原为夫妻共同生活所负的债务，以共同财产偿还。如该项财产不足清偿时，由双方协议清偿；协议不成时，由人民法院判决。
男女一方单独所负债务，由本人偿还。”

分居两年，申请离婚的，通过法院诉讼离婚，提供你们分居的证据。
通过诉讼离婚的，需要身份证、结婚证、诉状，可在被告住所地法院起诉，或者在被告居住超过一年以上的所在地法院起诉,如果被告下落不明或者监禁1年以上的，可以在原告所在地法院起诉离婚。
一审一般时3～6个月，二审时3个月。如果法院第一次判决不离的话，半年之后可以重新起诉，第二次起诉法院一般情况下应当判离。