自建房屋，实际建筑面积比房产证登记的面积大，房屋主体没有违章，拆迁时按哪个面积算

在房屋买卖过程中，拆迁房的房产证涉及情况比较多，需要具体情况具体分析。比如，拆迁房办房产证时还要交什么税？根据 税发【2010】32号《关于契税政策执行中若干问题的通知》
1、被拆迁房屋的个人依照拆迁补偿安置协议取得货币补偿，重新购置一处房屋的（即货币补偿安置），购房销售价款中未超出拆迁补偿款的部份免征契税；超出拆迁补偿款部份，应按适应税率征税。
2、被拆迁房屋的单位和个人依照拆迁补偿安置协议重新承受还建房屋（即房屋产权调换安置），不补缴产权调换差价款的，免征契税；应补缴产权调换差价的，对补缴款部份，按适用税率征收税。
(一)、 买房人应缴纳税费：
1、契税：房款的
1.5%(面积在144平米以上的需要缴纳3%，面积在90平米以下并且是首套房的可以缴纳1%)
2、交易费：3元/平方米
3、测绘费：按各区具体规定
4、权属登记费及取证费：按各区具体规定，一般情况是在200元内。
(二)、 卖房人应缴纳税费：
1、交易费：3元/平方米
2、增值税：差价*
5.5%(房产证未满5年的)
3、个人所得税:房产交易盈利部分的20%或者房款的1%(房产证满5年并且是少有住房的可以免除)
拆迁安置房屋的土地是划拨的，因此与购买的正常商品房（商品房开发，开发商取得土地是通过出让方式）是有区别的。

房屋拆迁纠纷一般分为两类，一类是：国有土地上房屋的拆迁，应当依据《国有土地上房屋征收与补偿条例》规定的法定程序执行。在该法中也规定了政府及职能部门的职责，如果存在违法且侵害他人合法权益，则权益被侵害人可以依法申请行政复议或行政诉讼。
对于补偿标准问题，法律规定是不低于周边房屋市场价格。另一类是：集体土地上房屋的拆迁，应当依照《土地管理法》及各地集体土地上房屋拆迁办法执行，此类拆迁也应依法进行。
补偿标准也应当参照国有土地上房屋征收与补偿条例精神执行。由于房屋拆迁案件涉及众多部门，众多单位，征收过程中又有很多的部门作出各种行政行为，案件非常复杂，维护权益建议聘请专业律师。

关于自建房房产证的相关内容，规定，每个地区的规定都不同，举个例子：连云港自建房房产证是在连云港市房管局办理的，单位地址在连云港市赣榆区黄海东路0409号。
二、依据《房屋登记办法》规定：　　第四条　　房屋登记，由房屋所在地的房屋登记机构办理。　　第十三条　　共有房屋，应当由共有人共同申请登记。　　共有房屋所有权变更登记，可以由相关的共有人申请，但因共有性质或者共有人份额变更申请房屋登记的，应当由共有人共同申请。　　第三十三条　　申请房屋所有权转移登记，应当提交下列材料：　　
（一）登记申请书；　　
（二）申请人身份证明；　　
（三）房屋所有权证书或者房地产权证书；　　
（四）证明房屋所有权发生转移的材料；　　
（五）其他必要材料。　　前款第
（四）项材料，可以是买卖合同、互换合同、赠与合同、受遗赠证明、继承证明、分割协议、合并协议、人民法院或者仲裁委员会生效的法律文书，或者其他证明房屋所有权发生转移的材料。
三、依据《城市房地产转让管理规定》第七条房地产转让，应当按照下列程序办理:
(一)房地产转让当事人签订书面转让合同;
(二)房地产转让当事人在房地产转让合同签订后90日内持房地产权属证书、当事人的合法证明、转让合同等有关文件向房地产所在地的房地产管理部门提出申请，并申报成交价格;
(三)房地产管理部门对提供的有关文件进行审查，并在7日内作出是否受理申请的书面答复，7日内未作书面答复的，视为同意受理;
(四)房地产管理部门核实申报的成交价格，并根据需要对转让的房地产进行现场查勘和评估;
(五)房地产转让当事人按照规定缴纳有关税费;
(六)房地产管理部门办理房屋权属登记手续，核发房地产权属证书。