你好，我现在是分居有三年了，男方不同意离婚，今年说协议离婚因为孩子的抚养权没有达成一致，就没有离，请问要怎么办

你好，我国《婚姻法》规定离婚有两种方式： 其一是双方协议离婚，然后都民政局办理离婚手续。 其二是在无法协议离婚的情况下，只能起诉到法院，要求判决离婚。 对于孩子的抚养权归属问题，要根据双方的各种条件进行分析，以有利于孩子的健康成长为原则，即谁的条件比较优越，对孩子的成长比较有利，那么孩子就判决归谁抚养。
另外，2岁以内的孩子判决归女方抚养的比较多，如果没有其他特殊情况。

通过诉讼离婚的，可在被告住所地法院起诉，或者在被告居住超过一年以上的所在地法院起诉,如果被告下落不明或者监禁1年以上的，可以在原告所在地法院起诉离婚。一审一般时3～6个月，二审时3个月。
如果法院第一次判决不离的话，半年之后可以重新起诉，第二次起诉法院一般情况下应当判离。诉讼离婚的诉讼费用如果不涉及到财产分割一般是50元，有财产分割的话，按照财产比例交费，具体可参照《诉讼收费办法》。

《婚姻法》规定：
　　第三十一条　男女双方自愿离婚的，准予离婚。双方必须到婚姻登记机关申请离婚。婚姻登记机关查明双方确实是自愿并对子女和财产问题已有适当处理时，发给离婚证。
　　第三十二条　男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。
　　人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。
　　第三十六条　父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或母直接抚养，仍是父母双方的子女。
　　离婚后，父母对于子女仍有抚养和教育的权利和义务。
　　离婚后，哺乳期内的子女，以随哺乳的母亲抚养为原则。哺乳期后的子女，如双方因抚养问题发生争执不能达成协议时，由人民法院根据子女的权益和双方的具体情况判决。
　　第三十七条　离婚后，一方抚养的子女，另一方应负担必要的生活费和教育费的一部或全部，负担费用的多少和期限的长短，由双方协议；协议不成时，由人民法院判决。
　　关于子女生活费和教育费的协议或判决，不妨碍子女在必要时向父母任何一方提出超过协议或判决原定数额的合理要求。