有限责任公司注册资金都是认缴的，在公司运营中投资的资金，算不算注册资金呢？

首先可以确定的是，注册资本缴清前的股权转让，是可以的。
1.《公司法》规定的股权转让，并未限于实缴出资部分对应的股权；换言之，出资未缴足的股权转让未被《公司发》所明文禁止。
2.另一方面，股权的转让，同时也是股东义务的转让。在受让方知悉该股权所对应出资未缴足的情况下（而且，受让方有义务至少从形式上审查转让方是否已经缴足出资），受让方受让股权，应视为其已同意承接转让方对公司所负的缴足未缴部分的义务，公司也可以向受让方要求承担缴纳出资的义务，从而保障公司的注册资本充实。
3.从实务操作看，一些有限公司未缴足出资的股权转让，工商部门对此并未提出任何异议，并已顺利办理的股东变更登记。最高人民法院关于适用《公司法》若干问题的规定
(三) 第十八条：“有限责任公司的股东未履行或者未全面履行出资义务即转让股权，受让人对此知道或者应当知道，公司请求该股东履行出资义务、受让人对此承担连带责任的，人民法院应予支持；公司债权人依照本规定第十三条第二款向该股东提起诉讼，同时请求前述受让人对此承担连带责任的，人民法院应予支持。
4.受让人根据前款规定承担责任后，向该未履行或者未全面履行出资义务的股东追偿的，人民法院应予支持。但是，当事人另有约定的除外。”
5.最高人民法院关于适用《中华人民共和国公司法》若干问题的规定
(三) 第十三条第二款：“ 公司债权人请求未履行或者未全面履行出资义务的股东在未出资本息范围内对公司债务不能清偿的部分承担补充赔偿责任的，人民法院应予支持；未履行或者未全面履行出资义务的股东已经承担上述责任，其他债权人提出相同请求的，人民法院不予支持。 ”

设立有限责任公司，应当具备下列条件：
1.股东符合法定人数。 法定人数是指法定资格和所限人数两重含义。法定资格是指国家法律、法规和政策规定的可以作为股东的资格。法定人数是《公司法》规定的注册有限责任公司的股东人数。《公司法》对有限责任公司的股东限定为二个以上五十个以下。
2.有限责任公司的注册资本为在公司登记机关登记的全体股东认缴的出资额。公司全体股东的首次出资额不得低于注册资本的百分之二十，也不得低于法定的注册资本最低限额，其余部分由股东自公司成立之日起两年内缴足;其中，投资公司可以在五年内缴足。
有限责任公司注册资本的最低限额为人民币三万元。法律、行政法规对有限责任公司注册资本的最低限额有较高规定的，从其规定。

国内公开发行及上市的基本条件（规模要求）：
1、净利润：主板上市要求3年盈利，且累计超过3000万元。创业板（征求意见）上市要求2年盈利，且累计不少于1000万元；或者最近1年盈利，且净利润不少于500万元。
2、营业收入：主板上市要求3年累计超过3亿元。创业板（征求意见）上市要求最近一年营业收入不少于5000万元，最近两年营业收入增长率均不低于30%。
3、经营性现金净流入（与营业收入指标二选一）：主板上市要求3年经营性现金流量净额累计超过5000万元。
创业板（征求意见）上市暂无要求。
4、净资产及股本总额：主板上市要求发行前股本总额不少于3000万元。创业板（征求意见）上市要求发行前净资产不少于2000万元，发行后股本总额不少于3000万元。