双方同意签署调节村干部所写土地使用权的协议书，有法律效率吗？

以调解协议为例，按照规定，调解书必须双方签收之后才会生效。法条依据：《民事诉讼法》第九十七条　调解达成协议，人民法院应当制作调解书。调解书应当写明诉讼请求、案件的事实和调解结果。
调解书由审判人员、书记员署名，加盖人民法院印章，送达双方当事人。调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。

国有土地征收，现在指的是对国有土地上房屋的征收与补偿，基本上与你的土地使用权还有多长时间是没有关系的，一般征收都会有征收补偿的评估价格。如果地大于房，会有专门的补偿。
各地拆迁补偿标准不同，同一地不同拆迁项目的补偿标准，也往往是不同的。
从实务来看，每个拆迁项目通常都有一个拆迁补偿安置方案，拆迁人也会与被拆迁人签订拆迁补偿安置协议，按前述方案和协议确定具体拆迁补偿安置标准。

土地纠纷的实质是土地权属纠纷，即是指对土地所有权和使用权的争议。它包括农地、山地、草原、水域等因所有权、使用权受到侵害而引起的争执。权属纠纷发生的原因很多，主要是由于地界不清、土地权属紊乱、政策和体制的变更，以及其他历史遗留问题等。
　　
(一)土改、合作化时留下来的土地权属未定，地界无明显的标志或土地证上规定得不够明确。
　　
(二)公社化时期体制调整，新划地界不清或调整不合理，协议书订得不明确。
　　
(三)因过去无偿占有或平调而变动的土地。
　　
(四)因历年集体搞水利建设、平整土地造成地界变更，土地原有状况或新队之间归并，原有田界铲除，无原始记载，现在恢复乡村原建制无历史依据可查考的土地。
　　
(五)因行政区划变更，原社队之间、社队与国有土地之间因插花地互越地界以致地界不清的土地。
　　
(六)因移民开荒，侵占他队的荒山、荒坡、荒地和原权属不清的公共土地。
　　
(七)因其他各种历史原因遗留下来的土地瓜葛问题。
　　
(八)因土地的征用、承包等引起的所有权和使用权的变更而产生的权属争议等。
　　
(九)乡镇集体企业建设用地，由于过去没有具体规定，需要重新给予核定。
　　
(十)乡村公共事业或公益事业占有的土地，过去没有给过补偿，群众后来提出要补偿等问题。
　　
(十一)1950年无偿划拨的荒山、荒坡、荒地等，当时未计算面积，并无规定地界，几经变迁，从而引起地权、地界的争议。
　　
(十二)有的单位征用土地的证据遗失，无据可查，从而引起的土地争议。
　　
(十三)农民使用的宅基地，因地界不清，从而引起的土地争议及城镇个人因地界不清引起的土地权属争议。
　　
(十四)企业与企业之间因土地权属不清引起的土地属争议。