可以处理恶意扣留工资、恶意扣留工资不给加班工资的，可以处理此事的

公司长期不支付加班费，劳动者可以申请劳动仲裁要求支付。在职或离职后申请都可以。
　　工作日加班费的计算方式：月工资÷
21.75÷8×加班小时数×
1.5倍；
　　
　　双休日加班费的计算方式：月工资÷
21.75÷8×加班小时数×2倍；
　　
　　法定节假日加班费的计算方式：月工资÷
21.75÷8×加班小时数×3倍。
　　证明加班时间方面的证据主要包括：考勤表、考勤卡、加班审批单、加班通知、监控录像、证人证言、加班时所做工作形成的书面文字记录、电子邮件等。
　　《劳动法》第四十四条　有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
　　
（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
　　
（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
　　
（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

根据《劳动合同法》第八十五条　用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿;劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分;逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：　　
(一)未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的;　　
(二)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的;　　
(三)安排加班不支付加班费的;　　
(四)解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。　　劳动法第四十四条规定：有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：　　
(一)安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬;　　
(二)休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬;
(三)法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。　　如果用人单位安排劳动者加班，却不依据劳动法的上述规定支付加班工资的，属于违法行为，应当依法承担法律责任。　　准备劳动合同、加班证明等证明材料。　　如果没办法和用人单位协商解决的，可以向劳动监察大队投诉、向劳动仲裁委员会申请仲裁。

若用人单位拖欠工资，劳动者可以通过以下方式讨薪：

1、劳动者可以到当地人力资源和社会保障局劳动监察投诉。
　　
2、可以到当地人力资源和社会保障局劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付工资。如果未签订劳动合同，可以要求支付未签订劳动合同的双倍工资。如果是以拖欠工资提出的解除劳动关系，还可以要求支付经济补偿金。
　　
3、有欠条的，可以直接起诉到法院，要求支付欠条里的工资数额。