三人合作经营申请注册一个企业，三人注资一样，一人是有工作中的，只注资不参加股份怎么算？

关于合伙股份的情况，要根据具体情况分析，例如：如果是一般有限责任公司的话，股份是按照投资金额和注册资金的比例确定的，利润也是按照股份占有情况按照比例分配的，这个没有什么比较好的说法，直接按照股权比例分配。

公司注册时提供的公司章程和股东会决议中规定了股权分配和利润分配，除非有特殊要求，否则按照正常分配原则即可。

注册普通有限责任公司就可以了，在公司章程和股东会决议中规定有关公司的每个人的权力和义务，例如股权比例，个人职责，如何分红等等，还有规定公司注册资本和认缴期限等，法定代表人可以是股东，也可以不是股东。

注册公司需要办理营业执照、组织机构代码证、税务登记证，如果经营范围有需要许可的项目，则需要办理相应的许可证。

合伙企业劳务出资要注意的风险，　　合伙企业法规定，经全体合伙人协商一致，合伙人也可以用劳务出资。对于什么样的人可以劳务出资，以及如何量化以劳务出资的合伙人的特殊技能等问题，因涉及每一个合伙人的切身利益，法律没有做出具体规定，而交由全体合伙人自行协商确定。
　　劳务出资常见的法律风险有：　　第一，劳务出资价值确定的法律风险。　　劳务出资的价值很难进行准确的衡量，更多依赖合伙人之间形成统一的意见。当合伙人只是同意以劳务出资，但并未明确其价值时，不确定的法律风险会因这种不规范而产生。
在评估时，还需要看待合伙企业是否存在实际的利润分配比例或损失承担等作为劳务出资价值的补充确定。　　第二，劳务出资人承担责任的法律风险。　　劳务出资人并不像其他以财产出资的合伙人，其可能是因为本身不具备财产出资能力，因此在承担责任问题应当事先明确其是否按照正常出资人承担。
当劳务出资人具有足够的财力时，该法律风险则可以忽略。　　第三，劳务出资停止提供劳务的法律风险。　　劳务出资对企业的价值在于其提供的劳务，然而一旦确定了其在合伙企业中的所占的比例，劳务出资人不再为企业提供服务，其出资份额不会自动消失。
不能简单地认为劳务出资人不提供的行为属于撤回出资的退火行为，毕竟劳务出资人会随着劳动能力的丧失或技能的丧失不具备继续提供劳务的必要性。一些合伙企业会因此争议是否应当降低其所占的出资比例。
　　第四，劳务出资退火的法律风险。　　劳务出资人不像其他合伙人对企业有实际的投入，当其退火时，合伙企业实际上不再享有其提供的劳务。各合伙人常常因为劳务出资人退火行为发生矛盾。

1、合伙企业
（1）优点
设立成本低，但高于独资企业，设立快，对有限合伙人来说承担有限责任。
（2）缺点
对无限合伙人来说承担无限责任，筹资困难，但比独资企业要容易，产权转让困难。
2、有限责任公司
（1）优点
A. 有限责任公司既保留了股份有限公司有限责任的优点，又克服了股权分散、股东责任心不强的缺点；
B. 有限责任公司既继承了公司股份可转让的优点，又克服了股份有限公司股份转让过于频繁的缺点；
C. 有限责任公司设立程序比股份有限公司简便，内部管理比较容易。
（2）缺点
A. 有限责任公司筹资规模和范围受到严格限制，无法与股份有限公司开展竞争；
B. 公司转让股份限制严格，甚至在股东对公司经营不满时，也不能自由转让出资，不利于对经营者进行有效监督。