股东签署退款协议后，对方私人持有营业执照经营公司的权利，请问这种行为是否合法？

股东是公司法上的概念；合伙是合伙企业或者临时合伙组织的经营方式。投资更多的是一个经济概念，我认为可以理解为凡投入资金进行经济活动，都可以认为是投资。 关于你提出的新问题，因为涉及标的金额较大，处理不当有可能给你带来较大的损失，所以，康律师建议你务必在当地聘请一位好的律师为你提供代理服务。律师在这里的解答仅仅给你一个参考，但不能解决你的问题并实现你的权利。这一点希望你能够明确意识到。 关于问题的解答：
1.你签订的协议是否是增资入股协议、你是否有有效的股东身份，这直接影响你的权利。根据你的叙述，有可能你的股东身份不能成立。具体认定要看协议的内容。
2.公司从管理需要，可以通过一定的程序任命高级管理人员，董事会就有权聘任经理。所以，你不能对你的职务变动提出赔偿。在劳动法意义上，如果公司的安排侵犯了你的劳动者权利，你有权提出索赔。
3.你准备退股，这要适用公司法关于股东转让股份的规定；如果你签订的协议不是入股协议，则你可以以对方为被告请求判决对方承担欺诈的民事责任。
4.你想要获得补偿，这适用劳动法的规定。补偿的标准是每工作一年补偿一个月工资，最多补偿12个月（工作12年），但是如果是劳动者自己提出辞职的，可以不补偿。

关于公司股东退股的问题，
1、股东不得退股为法律的禁止性规定，违反之构成无效民事行为；法律之所以如此规定是为公司资本维持原则及公司债权人利益保护只考量；
2、股东可以将其对公司的出资进行转让，包括内部转让和外部转让，如果与另一股东签订的是股权转让协议则受法律保护，如果想现有股东以外转让出资，则涉及股东优先购买权的问题。

公司股东滥用公司法人及股东有限责任而逃避债务，应当对公司债务承担连带责任。股东非货币出资显著低于章程所定价额的，公司设立时的其他股东承担连带责任。一人公司股东不能证明公司财产独立于个人财产的，对公司债务承担连带责任。
相关义务：
一、遵守法律、行政法规和公司章程；
二、按时足额缴纳出资，不得抽逃出资；
三、不得滥用股东权利损害公司或者其他股东的利益；应当依法承担赔偿责任。
四、不得滥用公司法人独立地位和股东有限责任损害公司债权人的利益。公司股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的，应当对公司债务承担连带责任。