我和孩子的父亲是结婚出生的孩子，孩子的户口是2011年的户口，当时给孩子户口的是本村证书的户口，现在派出所说我们的户口不合法，必须注销孩子的户口

你可以到户籍派出所询问为何不给办理，如果你占理，你可以到户籍派出所上一级单位依法投诉维权。
《关于解决无户口人员登记户口问题的意见国办发〔2015〕96号》：
二、依法为无户口人员登记常住户口
　　
（一）不符合计划生育政策的无户口人员。政策外生育、非婚生育的无户口人员，本人或者其监护人可以凭《出生医学证明》和父母一方的居民户口簿、结婚证或者非婚生育说明，按照随父随母落户自愿的政策，申请办理常住户口登记。申请随父落户的非婚生育无户口人员，需一并提供具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定证明。
　　
（二）未办理《出生医学证明》的无户口人员。在助产机构内出生的无户口人员，本人或者其监护人可以向该助产机构申领《出生医学证明》；在助产机构外出生的无户口人员，本人或者其监护人需提供具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定证明，向拟落户地县级卫生计生行政部门委托机构申领《出生医学证明》。无户口人员或者其监护人凭《出生医学证明》和父母一方的居民户口簿、结婚证或者非婚生育说明，申请办理常住户口登记。
　
三、切实抓好组织实施
（五）强化责任落实。各有关部门要进一步分解细化任务，落实责任分工，狠抓各项政策措施的贯彻落实。公，安，部，要会同民，政，部、卫，生，计，生，委，等部门加强对各地区的督查指导，对责任不落实、工作不力的，依法依规严肃追究责任。