我可以和我的商店签订协议，后来发现公司的营业执照没有登记参加年度检查，我可以用这个作为宣称合同无效的理由吗？

《合同法》第五十二条 有下列情形之一的，合同无效：

（一）一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益；

（二）恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益；

（三）以合法形式掩盖非法目的；

（四）损害社会公共利益；

（五）违反法律、行政法规的强制性规定。

保险合同的无效，是指保险合同虽已订立，但由于违反国家规定或者其他原因，合同在法律上自始不发生效力，双方当事人不受合同约束的情形。根据无效的程度和范围，可以分为全部无效和部分无效两种情况。其中部分无效指合同的某些条款虽然违反法律规定，但并不影响其他条款的法律效力。引起保险合同无效的主要原因有：
　　
1、基于民法上的原因，如《民法通则》和《合同法》中关于无效合同的规定：保险合同的内容违反法律和行政法规、有欺诈和胁迫、无权代理、双方代理、恶意串通以及违反国家利益和社会公共利益等行为。
　　
2、基于保险法上的原因，如:
　　
(1)超额保险;
　　
(2)投保人对保险标的无保险利益;
　　
(3)未经被保险人书面同意的以死亡为给付保险金条件的保险(法律另有规定的除外);
　　
(4)保险人未对投保人作出说明的免责条款等。
　　保险合同无效，自始不发生法律效力，在发生保险合同约定的保险事故时，保险人不承担保险责任。当事人因无效保险合同取得的利益应当依照民法上对无效合同处理的原则，或者予以返还，或者予以收缴。

合同无效，能请求法院判决对方赔偿违约金吗？
因为违约的前提是合同有效，违约指违反有效合同所规定的义务所产生的责任后果，只有在合同有效的情况下，才能够存在违约。
如果合同是无效的话，这个合同根本就不存在了，也就谈不上违约。
违约金是违约责任形式，合同无效，违约条款作为从合同也无效，所以不能判决承担违约责任。