工作中的住院费用是我自己垫付的，如果现在公司报告了工作上的事故，我住院的费用怎么处理呢

如果用人单位为劳动者购买了工伤保险，则该费用由工伤保险报销，劳动者可以享受工伤医疗待遇。
工伤医疗待遇包括：
(1)职工治疗工伤或职业病所需的挂号费、住院费、医疗费、药费、就医路费全额报销；
(2)工伤职工需要住院治疗的，按照当地因公出差伙食补助标准的2/3发给住院伙食补助费；
(3)经批准转外地治疗的，所需交通、食宿费用按照本企业职工因公出差标准报销。

工伤认定不收费。工伤保险待遇办理程序如下：工伤认定——评残或鉴定职业病——确定赔偿数额——执行。
具体流程如下：
1、申请工伤认定（用人单位所在地的工伤认定科，用人单位30日内不申请工伤认定的，受伤职工可以自行申请，最高期限为1年之内）
2、申请劳动能力和停工留薪期鉴定（用人单位所在地的劳动能力鉴定委员会）
3、申请赔偿数额仲裁（用人单位所在地或合同履行地的劳动仲裁委）
4、用人单位未按仲裁决定支付费用的，申请法院强制执行。

职工工伤如何处理，　　职工发生工伤，首先是抢救治疗，保证生活。然后是进行工伤认定，确定是否属于工伤范围。再后是鉴定伤残等级，作为计发待遇的依据。　　
1、接到工伤报告后，安排合适的人员在第一时间将伤员送到合适的医疗机构就诊、抢救。　　
2、保护事发现场，拍片、人员访谈做笔录，展开一系列的调查和收集资料工作，并一一归档。　　
3、最好人力资源方面也慰问一下伤员，顺便再确认一下工伤的整个过程。同时交待其收齐好所有医疗发票。　　
4、写好工伤报告，下发处理文件。　　
5、在事发30日内上报劳动部门有关方面，申请《工伤认定》。　　
6、在2个月内等待劳动部门有关方面的《工伤认定》结果。　　
7、工伤被有关部门认定，下发《工伤认定书》，工伤员工签字，复印存档，复件寄有关部门。　　
8、医疗期满，病情稳定，申请工伤等级鉴定。　　
9、报销相关医疗费用。所需材料如下：工伤认定书复印件;劳动能力鉴定结论书复印件;劳动能力鉴定委员会的确认意见书复印件;医疗凭证;工伤人员身份证复印件;工伤人员身份证复印件;银行到帐的账户复印件;劳动能力鉴定费发票;《工伤保险待遇申请表》加盖公章;委托单位办理的，授权委托书及被委托人身份证复印件;配置辅助器具的证明。　　
10、上保险中心申领一次性伤残补助金。　　
11、如果单位与员工解除劳动合同的，为其做表发放一次性工伤医疗补助和伤残就业补助金。　　
12、在整个过程中，一定要做好记录，记录种类如下：发薪记录;受伤员工主张权利，人力资源部工作依据;劳动合同签订情况。