请问下合并后股东所持股份变更个人所得税怎么交?

流程：
1、法定代表人签署的《公司变更登记申请书》(领取，公司加盖公章);

2、《企业(公司)申请登记委托书》(领取，公司加盖公章)，应标明具体委托事项和被委托人的权限;

3、有限责任公司变更股东提交原股东会决议(内容包括：转让双方当事人、转让标的、数额，其他股东优先受让权力的行使情况等，由股东盖章或签字(自然人股东);

国有独资公司有限责任公司变更出资人提交国务院或者国务院授权的机构、部门转让出资的文件。

4、转让双方签署的股权转让协议;

5、有限责任公司变更股东提交新股东会决议(内容包括：新的股东会成立，修改公司章程，决定是否调整经营管理机构由股东盖章或签字(自然人股东);

股份有限公司变更股东提交新股东会决议(内容包括：新的股东会成立，修改公司章程，决定是否调整经营管理机构，由发起人盖章或者出席会议的董事签字)。

6、章程修正案：

有限责任公司由股东盖章或签字(自然人股东);

股份有限公司由发起人盖章或出席会议的董事签字;

国有独资有限责任公司由投资人盖章。

7、新股东或发起人股受让人或者国有独资有限责任公司出资人的法人资格证明或自然人身份证明;

企业法人提交营业执照复印件;事业法人提交事业法人登记证书复印件;社团法人提交社团法人登记证复印件;民办非企业提交民办非企业证书复印件;自然人提交身份证复印件。

8、法律、行政法规规定公司变更股东或发起人应报经审批的，提交有关部门的批准文件;

9、公司营业执照正副本。

注：依照公司登记管理条例设立的公司申请股东、发起人变更或者股份转让的变更登记适用本规范。

公司股东股份转让要缴哪些税如下：　　股权转让的双方要按万分之五税率缴纳印花税，对于股权转让所得，如果股东是自然人，要按20%税率缴纳个人所得税，如是法人股东，要按25%税率缴纳企业所得税。　　
1、购买股权的人A只需按照成交价格缴纳印花税，万分之五;　　
2、出售股权的人B以大于其初始投资数额出售的，则其差额按“财产转让所得”依20%税率缴纳个人所得税(如果是小于或等于其初始投资数额出售的，则不需要缴纳所得税)，同时按照成交价缴纳印花税，万分之五。　　依据：所得税法、印花税条例　　转让过程中通过挂牌还产生了其他的费用，比如在挂牌支付了交易费1万的，目前在中国这1万不可以减去再算所得税。　　
3、股权转让双方都要按照实际成交额缴纳印花税。　　印花税是在签订了转让合同之后，双方去企业驻地地方税务局缴纳，凭完税证去工商局办理股权变更手续。　　
4、股东出让股权，一般来讲公司权益没有变化，企业一般不用缴纳所得税。

应纳个人所得税税额=应纳税所得额×适用税率-速算扣除数
应纳税所得额=扣除三险一金后月收入-扣除标准
个人所得税的征收方式可分为按月计征和按年计征。个体工商户的生产、经营所得，对企业事业单位的承包经营、承租经营所得，特定行业的工资、薪金所得，从中国境外取得的所得，实行按年计征应纳税额，其他所得应纳税额实行按月计征。