公司吸收投资时，实际出资人与名义出资人不一致时，两者也签了股权代持协议，被投资公司只需对名义出资人办理相关手续吧？比如收到款时的收据，与名义出资人的投资协议等。

这种股权代持协议还是比较常见的。它的内容主要是：

1、给予员工（管理层）一定的股权收益，但是不给予决策权；

2、受赠人可以享有股权相对应的股权收益和股息分红；

3、锁定期过后才赠予转让权。

这份股权代持协议是有效的，即使有名字打错了这样的小瑕疵，后面有签名，前面有甲乙双方名字，中间也有身份证号码，这种小瑕疵不影响合同的效力。
这份股权协议把股权中的决策权赠与给代持人，然而所有权没有赠与，更加不能转让（锁定期内），现在公司说想把这个股权代持协议一并处理掉，意思是连同解除劳动合同的赔偿一起把股权中的收益权一并给你算了。

然而公司的想法是一方面，劳动仲裁委员会会不会采纳一并解决也是一方面。
你们的股权代持协议是约定了管辖的，约定了如果有纠纷，管辖法院为公司所在地的人民法院，即使你同意，公司也同意，仲裁委也不可能裁。（如果裁了就可以向法院申请仲裁裁决无效了。）腾讯众创空间，一个去创业的平台。
所以现在看来也只有两条路：

1、劳动仲裁解决掉违法解除劳动合同的问题，支付双倍经济补偿金，然后股权代持协议另案处理；

2、劳动仲裁中实行庭外和解，公司把股权代持协议的解决方案给题主你，题主你也接受，连同经济补偿金一并支付，达成庭外和解，题主向仲裁委撤诉。

隐名股东是指为了规避法律或出于其他原因，借用他人名义设立公司或者以他人名义出资，但在公司的章程、股东名册和工商登记中却记载为他人的出资人。与此相对应，显名股东(或挂名股东)是指记载于工商登记资料上而没有实际出资的股东。
从我国现行法律来看没有明确的条文对隐名股东进行规定。公司法中仅对普通股东作了规定，明确了普通股东的权利义务。但实践中，隐名股东是大量存在的，且多数情况下，都会制订协议，明确相互权利义务关系。

1-股权争议中出资证明书、投资协议、股东名册、公司章程都是直接证据，出资证明书直接证明股东的出资情况是确认股权最有利的证据。2-出资证明书属于源泉证据，公司设立后，公司应依法向股东签发出资证明书，无论是实际出资还是认购股权，发起人均能取得股东身份。股东取得出资证明书后，有权要求公司将自己记载于股东名册之中，并要求公司将其股东身份登记于公司的登记机关。出资证明书是产生效力证据、对抗证据的前提。3-投资协议属于源泉证据，是继受股东取得股东资格的前提条件，经工商备案的投资协议具有其公信力和对抗第三人的公示力。4-股东名册属于效力性证据，具有当然授予股东资格的法律效力，也是公司内部股权确认的重要依据。5-公司章程等登记类文书具有较强的公示、公信效力，属于股权的对抗要件，未经登记的事项不得对抗第三人。6-股权的实质要件在公司内部具有优先效力。出资证明书、各类股权变动类文书、股东名册具有创设股权的效力，是股东真实的意思表示，不涉及交易的安全，故优先适用实质要件。当股东或公司与第三人发生股权上的争议时，涉及交易安全保护，应奉行商法的外观主义，以对抗证据为依据。公司章程登记是形式要件，具有对外宣示的功能和证权的效力，但是在处理与公司以外的第三人的争议中，形式要件优于实质要件，公司未经登记的事项不得对抗善意第三人。7-《公司法》（2014版）第11条　设立公司必须依法制定公司章程。公司章程对公司、股东、董事、监事、高级管理人员具有约束力。《公司法》第31条　有限责任公司成立后，应当向股东签发出资证明书。　　出资证明书应当载明下列事项：　　
(一)公司名称；　　
(二)公司成立日期；　　
(三)公司注册资本；　　
(四)股东的姓名或者名称、缴纳的出资额和出资日期；　　
(五)出资证明书的编号和核发日期。　　出资证明书由公司盖章。　《公司法》第32条　有限责任公司应当置备股东名册，记载下列事项：　　
(一)股东的姓名或者名称及住所；　　
(二)股东的出资额；　　
(三)出资证明书编号。　　记载于股东名册的股东，可以依股东名册主张行使股东权利。　　公司应当将股东的姓名或者名称向公司登记机关登记；登记事项发生变更的，应当办理变更登记。未经登记或者变更登记的，不得对抗第三人。《公司法》解释三第23条规定：“当事人之间对股权归属发生争议，一方请求人民法院确认其享有股权的，若能够证明其已经依法向公司出资或认缴出资，且不违反法律法规强制性规定的，则可确认其股东资格。”