你好，我和我丈夫在不到3个月的时间里已经分居两年了。我们可以单方面申请离婚吗？

首先，分居两年并不能成为离婚的理由。生活中，夫妻分居的原因有很多种，比如异地工作等等。因此，并不是只要分居就可以作为离婚的理由。按照法律的规定，必须是因为感情不和分居导致分居满两年，才可以作为离婚的理由。
其次，因感情不和导致分居满两年只是法院作为判定准予双方离婚与否的一个考虑因素，法院必须根据整个案情，判断夫妻感情是否确已破裂。
最后，因感情不和导致分居满两年不能自动离婚。
法律没有规定分居可以自动离婚，离婚必须按照法律程序进行，分居两年不可以自动离婚、分居多久都不可以自动离婚。

可直接向法院起诉离婚。起诉离婚需要提交起诉状一式两份、原告本人身份证、结婚证等证件材料，到被告住所地起诉立案，如果被告住所地与经常居住地不一致的，到被告经常居住地人民法院起诉立案；如果被告有民事诉讼法第二十二条规定情形之一的，到原告住所地或经常居住地人民法院起诉立案。根据《中华人民共和国民事诉讼法》规定：第二十一条对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。第二十二条下列民事诉讼，由原告住所地人民法院管辖；原告住所地与经常居住地不一致的，由原告经常居住地人民法院管辖：
（一）对不在中华人民共和国领域内居住的人提起的有关身份关系的诉讼；
（二）对下落不明或者宣告失踪的人提起的有关身份关系的诉讼；
（三）对被采取强制性教育措施的人提起的诉讼；
（四）对被监禁的人提起的诉讼。第一百二十条起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民法院记入笔录，并告知对方当事人。第一百二十一条起诉状应当记明下列事项：
（一）原告的姓名、性别、年龄、民族、职业、工作单位、住所、联系方式，法人或者其他组织的名称、住所和法定代表人或者主要负责人的姓名、职务、联系方式；
（二）被告的姓名、性别、工作单位、住所等信息，法人或者其他组织的名称、住所等信息；
（三）诉讼请求和所根据的事实与理由；
（四）证据和证据来源，证人姓名和住所。

法律上的分居是以夫妻双方因为感情不和而不存在性生活的共同居住，互相不履行夫妻义务为标志。夫妻中一方不同意离婚另一方可以起诉离婚，起诉离婚需要到对方所在地或者经常居住地法院起诉。起诉离婚的程序包括：
1、起草起诉状；
2、准备诉讼所需要的证据；
3、向有管辖权的法院递交起诉状和证据。起诉离婚通常会涉及夫妻共同财产分割、子女抚养、债务承担等等问题，建议最好可以委托律师介入协助。