员工旷工处理方式一般是：第一次旷工，通过口头或书面警告，让本人认识到错误的严重性并且责令反省；第二次旷工，以全公司通报批评的方式警示本人及其他员工，并由主管领导进行谈话，记大过处分；第三次旷工，开除或劝退。
在生活中，有的用人单位会以直接员工旷工作为辞退员工的理由。此时，用人单位需要按照如下步骤辞退旷工的员工：
１、查公司内部的规章制度，确认员工的旷工行为严重违反用人单位的规章制度的。
２、通知被辞退人员相关情况，并出具解除劳动合同通知书；
３、按离职要求办理离职手续，向劳动者出具离职证明、住房公积金等相关手续，结清工资；
４、给劳动者办理社保停缴等手续，并在人事台帐上进行备注。
《劳动法》第二十五条 劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
(一)在试用期间被证明不符合录用条件的;
(二)严重违反劳动纪律或者用人单位规章制度的;
(三)严重失职、营私舞弊，对用人单位利益造成造成重大损害的;
(四)被依法追究刑事责任的。
