如果对方在分居期间未支付抚养费，这个在离婚时是可以主张的。因为分居期间属于婚姻存续期间，抚养费从夫妻共同财产中支付。
婚姻法第二十一条规定，父母有对子女抚养教育的义务，分居期间并没有离婚，所以应从夫妻共同财产中支付抚养费。根据该规定，父母对子女的抚养义务是法定存在的，该义务应自子女出生之日起一直延续至子女成年或能独立生活为止，不管是婚内还是婚外、婚生子女抑或是非婚生子女。
至于补多少，可以根据子女在此期间的花费来主张，如果对方有固定收入的，抚育费一般可按其月总收入的百分之二十至百分之三十的来主张。如果无固定收入的，抚育费的数额可依据当年总收入或者同行业平均收入，并参照上述比例来主张。如有特殊情况的，可适当的提高或降低。
《婚姻法》第二十一条 父母对子女有抚养教育的义务；子女对父母有赡养扶助的义务。
父母不履行抚养义务时，未成年的或不能独立生活的子女，有要求父母付给抚养费的权利。
子女不履行赡养义务时，无劳动能力的或生活困难的父母，有要求子女付给赡养费的权利。
禁止溺婴、弃婴和其他残害婴儿的行为。
