不是车主开车闯红灯扣该车上驾驶证持有人的分，扣分是按驾驶证上的姓名扣分。车辆应当按照交通信号等通行，机动车驾驶人驾驶机动车违反道路交通信号灯通行规定的，一次扣6分。
《道路交通安全法》第三十八条规定，
车辆、行人应当按照交通信号通行；遇有交通警察现场指挥时，应当按照交通警察的指挥通行；在没有交通信号的道路上，应当在确保安全、畅通的原则下通行。
《道路交通安全违法行为记分分值》
二、机动车驾驶人有下列违法行为之一，一次记6分：
（一）机动车驾驶证被暂扣期间驾驶机动车的；
（二）驾驶机动车违反道路交通信号灯通行的等。
《道路交通安全法》第三十八条
车辆、行人应当按照交通信号通行；遇有交通警察现场指挥时，应当按照交通警察的指挥通行；在没有交通信号的道路上，应当在确保安全、畅通的原则下通行。
