借款合同复印件经对方当事人同意的有效。借款合同原则上应当提交原件。如果材料是复印件的话，复印件通过其他材料加以引证，是可以作为证据存在的。如果原件遗失的，需要及时把保存其他证据材料，便于法庭的审理。
根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第十条的规定，当事人向人民法院提供证据，应当提供原件或者原物。如需自己保存证据原件、原物或者提供原件、原物确有困难的，可以提供经人民法院核对无异的复制件或者复制品。
《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第十条
当事人向人民法院提供证据，应当提供原件或者原物。如需自己保存证据原件、原物或者提供原件、原物确有困难的，可以提供经人民法院核对无异的复制件或者复制品。
