根据《土地管理法》第六十六条第一款的规定，农民的土地使用证被收走的情况如下：
1、为乡（镇）村公共设施和公益事业建设，需要使用土地的；
2、不按照批准的用途使用土地的；
3、因撤销、迁移等原因而停止使用土地的。
《土地管理法实施条例》第七条规定，依照《土地管理法》的有关规定，收回用地单位的土地使用权的，由原土地登记机关注销土地登记。
土地使用权有偿使用合同约定的使用期限届满，土地使用者未申请续期或者虽申请续期未获批准的，由原土地登记机关注销土地登记。
《土地管理法》第六十六条第一款
有下列情形之一的，农村集体经济组织报经原批准用地的人民政府批准，可以收回土地使用权：
（一）为乡（镇）村公共设施和公益事业建设，需要使用土地的；
（二）不按照批准的用途使用土地的；
（三）因撤销、迁移等原因而停止使用土地的。
《土地管理法实施条例》第七条
依照《土地管理法》的有关规定，收回用地单位的土地使用权的，由原土地登记机关注销土地登记。
土地使用权有偿使用合同约定的使用期限届满，土地使用者未申请续期或者虽申请续期未获批准的，由原土地登记机关注销土地登记。
