医疗纠纷的处理程序是：
1、医疗纠纷或投诉发生后，所在科室负责人应立即向医务科报告；
2、所在科室应先进行调查，并迅速采取积极有效的处理措施，控制事态，争取科内解决，防止矛盾激化，如果患者能够接受，纠纷投诉到此终止；
3、如果患者不能接受，医务科无法解决的，建议患者或家属按法定程序进行医疗鉴定或者起诉。
《医疗事故处理条例》第四十六条规定，发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。
《医疗事故处理条例》第四十六条
发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。
