农村集体使用权证丢失，可以按照以下流程补办：
1、在申请补办前，在指定的报纸上公告，表明土地使用证已遗失；
2、到土地行政管理部门申请补办；
3、提供材料，包括身份证明、登记原因证明等材料；
4、查档核实后，核发新的土地使用权证。
《不动产登记暂行条例》第十五条规定，当事人或者其代理人应当向不动产登记机构申请不动产登记。
不动产登记机构将申请登记事项记载于不动产登记簿前，申请人可以撤回登记申请。
第二十七条第一款规定，权利人、利害关系人可以依法查询、复制不动产登记资料，不动产登记机构应当提供。
《不动产登记暂行条例》第十五条
当事人或者其代理人应当向不动产登记机构申请不动产登记。
不动产登记机构将申请登记事项记载于不动产登记簿前，申请人可以撤回登记申请。
第二十七条第一款
权利人、利害关系人可以依法查询、复制不动产登记资料，不动产登记机构应当提供。
