土地出让合同纠纷在有仲裁协议的前提下是可以进行仲裁的。我国《仲裁法》规定，除了婚姻、收养、监护、抚养、继承纠纷等具有人身、身份关系的案件以及依法应当由行政机关处理的行政争议案件不能约定仲裁之外，其他的民事纠纷，经过双方当事人的约定，是可以进行仲裁的。
根据《仲裁法》第三条的规定，下列纠纷不能仲裁：
（一）婚姻、收养、监护、扶养、继承纠纷；
（二）依法应当由行政机关处理的行政争议。
《仲裁法》第三条
下列纠纷不能仲裁：
（一）婚姻、收养、监护、扶养、继承纠纷；
（二）依法应当由行政机关处理的行政争议。
