有两个孩子离婚时抚养权一般是归父母双方，即一人抚养一个子女。
如果双方对于孩子抚养协商一致的，按照双方当事人的意思出具判决书。如果双方不能对孩子抚养协商一致，法院会按照一人抚养一个子女的原则进行判决。
通常情况下，两周岁以内的子女，原则上由女方抚养。两周岁到八周岁之间的子女，法院会按照有利于子女成长的原则判决。
根据《民法典》第一千零八十四条第三款规定，离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
《民法典》第一千零八十四条第三款
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
