公司要求怀孕员工出差，若不出差则要求她停薪留职，请问公司此做法合法吗？员工如何能保障自己的合法权益？

此外，该公司未将员工奖金、补助记入员工住房公积金基数，此做法是否合法？如果员工想起诉，应采取何种方式？

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职工停薪留职期间仍是该企业职工。停薪留职期间要与其它单位签订劳动合同，从事有收入的工作，应与原单位协商并征得其同意。停薪留职期满，本人继续在其它单位工作的，应与原单位终止劳动关系。
发生劳动争议，如属于《中华人民共和国企业劳动争议处理条例》规定的受理范围，劳动争议仲裁委员会应予受理。“停薪留职”期限及有关待遇：“停薪留职”的时间一般不超过二年。
“停薪留职”期间，不升级、不享受各种津贴、补贴和劳保福利待遇，“停薪留职”人员在从事其它有收入的劳动时，原则上应按月向原单位缴纳社会保险基金。

住房公积金贷款是政策性的个人住房贷款，一方面是它的利率低，另一方面主要是为中低收入的公积金缴存职工提供这种贷款。
公积金贷款期限在15年的利率是
3.6％，6－30年的利率是
4.05％；商业性贷款在1－5年的利率是
4.77％，6－30年的利率是
5.04％。
普通职工65周岁之前，副部级干部75周岁之前都可以申请住房公积金贷款。
在职职工申请住房公积金贷款的两个条件：第一要求建立公积金在一年以上，第二是要求在申请贷款之前连续6个月缴存公积金。
贷款额度：以房改房成本价购买公有住房，单笔贷款额度不超过30万元，同时不超过房价款的90％；购买商品房和经济适用住房，单笔贷款额度最高不超过30万元，同时不超过房价款的80％；购买二手住房申请住房公积金贷款，单笔贷款最高限额不超过30万元，同时不超过房屋评估价的80％。

所谓停薪留职，是指企业富余的固定职工，保留其身份，离开单位，从事政策上允许的个体经营。　　停薪留职是80年代初的事物，《劳动人事部、国家经济委员会关于企业职工要求“停薪留职”问题的通知》的规定，停薪留职的时间一般不超过二年。停薪留职期间，不升级，不享受各种津贴、补贴和劳保福利待遇;因病、残而基本丧失劳动能力的，可按退职办法处理。停薪留职人员在从事其他收入的工作时，原则上应按月向原单位缴纳劳动保险金，其数额不低于本人原工资的20%。　　停薪留职手续办理如下：　　
1、职工应提出书面申请，经企业批准，并签订停薪留职协议书。如果作了停薪留职申请，却未经企业批准就擅自离职的，企业要按违反劳动纪律来做处理。　　
2、停薪留职协议书的内容有：在停薪留职期间，企业停发工资、奖金、各种津贴和补贴，停止享受劳保福利等待遇;职工应按月向原单位缴纳待业保险基金、养老保险基金及其他费用;停薪留职期间按期缴纳费用的职工可计算连续工龄;职工在停薪留职期满前即未办理复工手续，又未办理辞职、调动手续的，企业待职工停薪留职期满后可按自行离职处理，并发给离职证明书;停薪留职期限，由企业根据生产或工作需要与职工具体商定。