一员工40岁，在扫路期间被从后的三轮电动摩托车撞倒，至使锁骨骨折，请问所在的单位要负赔偿责任吗？要给他垫付医药费吗？

上下班途中非本人主要责任交通事故可以认定工伤
单位不主动认定，本人可以去社保局申请工伤认定
和单位就工伤、费用有纠纷，可以申请劳动仲裁
《工伤保险条例》
第十四条　职工有下列情形之一的，应当认定为工伤：
（一）在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的；
（二）工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害的；
（三）在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害的；
（四）患职业病的；
（五）因工外出期间，由于工作原因受到伤害或者发生事故下落不明的；
（六）在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的；
（七）法律、行政法规规定应当认定为工伤的其他情形。

因为第三人侵权交通事故认定为工伤的可以双赔。
劳动者因为本单位执行工作任务之外的车辆交通肇事受到伤害，认定为工伤的，应当向第三方主张人身损害赔偿，在获得肇事方人身损害赔偿之后，可以享有工伤医疗之外的工伤保险待遇。
《社会保险法》
第四十二条　由于第三人的原因造成工伤，第三人不支付工伤医疗费用或者无法确定第三人的，由工伤保险基金先行支付。工伤保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。

摩托车撞上汽车怎样划分责任呢：

1.汽车撞摩托车责任划分：责任划分都要根据现场的情况、交通法则、路面情况等综合起来才能划分谁的责任大谁的责任小。如果是有一方在没有遵守交通规则的情况下被撞车。那么他肯定是主要责任。
2.交通事故责任划分的方法：
(一)全部责任和无责任一方当事人有下列情形之一造成交通事故的，该当事人应当负事故的全部责任，事故其他方当事人无责任：
1、一方当事人故意造成道路交通事故的，负全部责任，他方无责任。2，因一方当事人的过错导致道路交通事故的，其他方当事人无违章行为的，由过错一方当事人承担事故全部责任。
3、当事人逃逸，造成现场变动、证据灭失，公安交管部门无法查证道路交通事故事实的，由逃逸的当事人承担全部责任;4，当事人故意破坏、伪造现场及毁灭证据的，由其承担事故全部责任。
5、驾驶机动车发生与本车有关联的交通事故时，当事人不立即停车，不保护现场，致使交通事故责任无法认定的，应当负事故的全部责任。
6、当事人一方有条件报案而未报案或者未及时报案，使交通事故责任无法认定的，应当负全部责任。
7、各方均无导致道路交通事故的过错，属于交通意外事故的，各方均无责任。
(二)主要责任和次要责任当事人一方具有以下行为的负主要责任，另一方负次要责任：
1、机动车、非机动车、行人发生交通事故，交通事故各方当事人有违章行为，在交通事故中作用大的一方负主要责任，另一方负次要责任。
2、机动车与非机动车、行人发生交通事故，当事人各方有条件报案而未报案或者未及时报案，致使事故基本事实无法查清的，机动车方应当负主要责任，非机动车、行人一方负次要责任。
3、机动车与非机动车、行人发生交通事故后未立即停车，未保护现场，致使事故基本事实无法查清的，机动车一方负事故主要责任。