请问我怀孕后身体不舒服、有病假单，现在我们主管说我要是再不去上班、就让我自己辞职，我不想辞职

辞职之后一样可以维护自己的合法权利的。
需要携带劳动仲裁申请书、身份证复印件、相关证据，然后去当地仲裁委申请立案就可以。
关键就是需要你和用人单位有劳动关系的证据。
比如有公司名称的工装、工作证或工作牌（最好盖有公章）、工资卡、工资条、考勤记录、社会保险缴纳记录、同事证言（离职在职的都可以）、录音录像或者其它有你名字和公章的文件等（其中有公章的工作证、社会保险缴费记录、有你名字和公章的文件，有一个足以证明劳动关系）。

如果劳动者是按照正常的辞职程序辞职的，辞职到期以后，用人单位应当足额支付其劳动报酬，并为劳动者办理离职手续和社保转移手续。　　
一、个人提出离职分三种情况：　　　　
1、用人单位存在《劳动合同法》38条的情况，你书面提出解除劳动关系后可以立即走人不需要用人单位的批准，并可以要求支付剩余的工资及经济补偿金（每工作1年支付1个月工资）及办理离职手续等；　　
2、依据《劳动合同法》37条，你提前30天提出的书面离职，不需要用人单位批准就可以离职。其中，试用期提前3天书面提出；用人单位有义务结清工资办理离职手续。　　
3、没有提前30天提出离职，用人单位也不存在《劳动合同法》38条的情况，你直接提交辞职信就走人，这个时候就是你违法了，给用人单位造成的直接经济损失、招聘你产生的费用，用人单位可以要求你承担。　　
二、你可以通过快递或挂号信邮寄给用人单位解除劳动关系的通知（也就是通俗说的辞职信、辞职报告），这样便于保留证据。用人单位不支付你工资或不为你办理离职手续，你可以通过申请劳动仲裁解决；　　　　
三、相关法律依据：《劳动合同法》
37、
38、
46、
47、50条！

《劳动法》给予了女职工和未成年工一系列的特殊保护，比如在怀孕期间不得安排女职工从事一些劳动强度大的工作等。 　　法律规定，不得安排女职工在怀孕期间从事国家规定的第三级体力劳动强度的劳动和孕期禁忌从事的劳动。
对怀孕七个月以上的女职工，也不得安排其延长工作时间和夜班劳动。 　　不得安排女职工在怀孕期间从事国家规定的第三级体力劳动强度的劳动和孕期禁忌从事的劳动。 　　《劳动法》第六十一条规定，不得安排女职工在怀孕期间从事国家规定的第三级体力劳动强度的劳动和孕期禁忌从事的劳动。
　　不得安排怀孕七个月以上的女职工延长工作时间和夜班劳动。 　　第六十一条还规定，对怀孕七个月以上的女职工，不得安排其延长工作时间和夜班劳动。 　　第六十二条规定，女职工生育享受不少于九十天的产假。
　　不得安排女职工在哺乳未满一周岁的婴儿期间从事国家规定的第三级体力劳动强度的劳动和哺乳期禁忌从事的其他劳动。 　　第六十三条规定，不得安排女职工在哺乳未满一周岁的婴儿期间从事国家规定的第三级体力劳动强度的劳动和哺乳期禁忌从事的其他劳动，不得安排其延长工作时间和夜班劳动。
　　不得安排女职工在哺乳未满一周岁的婴儿期间，延长工作时间和夜班劳动。