2009年5月我和大哥就他的一处房产签了房屋买卖协议，约定签协议时付了7万元，余款两年内付清，期间我付了五千元给他，09年10月份他不想卖了，给我发了一个不卖给我的告知函，我多次交涉未果，10年7月又给我发了个告知函，内容差不多！后来要我加钱才肯卖给我，双方一直没有谈好，现在过了合同约定的两年付款期限，他到法院起诉我说我未按合同约定时间付款，要求解除合同，并且赔偿他合同约定的违约金4万元！我该怎么办？我手头有他给我发来的告知函，应该可以证明是他违约在先吗？这处房产是他们开发公司开发的房子，是一楼，原来规划是车库，他们私自改成住宅房公司内部购买!因为规划的问题，所以办不了房产证！这些是我最近才知道的!他也就是我大哥就是开发公司的法人！

违约金可以由买卖双方依据自己的意愿协商确定，但如果发生纠纷，并不一定能完全按照约定的数额执行。因为我们国家合同法的违约责任是一种补偿，只是弥补损失，而不是惩罚性的违约金。
因此如果合同中约定的违约金过高或过低，都可参照实际损失进行调整。具体说，如果合同中约定的违约金高于实际损失的30%，则认为违约金约定过高，需要适当调低;如果合同中约定的违约金低于实际损失，则守约方除可主张违约金外，对于违约金不足以弥补损失的部分，还可要求违约方赔偿，即参照实际损失调高违约金。

现在许多车库作为房产的附属房，没有产权证书，双方签订协议，一般法律效力。
　　法律依据《中华人民共和国合同法》
　　第十二条　合同的内容由当事人约定，一般包括以下条款：
　　
（一）当事人的名称或者姓名和住所；
　　
（二）标的；
　　
（三）数量；
　　
（四）质量；
　　
（五）价款或者报酬；
　　
（六）履行期限、地点和方式；
　　
（七）违约责任；
　　
（八）解决争议的方法。
　　当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。

房屋买卖合同卖方违约的情形：
1、交付不能。当出卖人不能向买受人交付标的物时，则构成根本性违约，除非出于不可抗力等免责事由，均应当承担违约责任。
2、交付迟延。商品房买卖合同中，出卖人的给付，实际应由两部分组成，一是将房屋交付使用，二是交付产权过户手续。此两种的给付迟延，只是给买受人造成某些经济损失，或遭受某些不方便，这些一般可主张违约赔偿即可获取补救，所以法律不应提供直接解约权。买受人只有在行使催告后，方可行使解约权。在此中，出卖人可主张某些不可抗力事由为抗辩。
3、商品房的质量瑕疵。《商品房买卖解释》第12条规定，因房屋主体结构质量不合格不能交付使用，或者房屋交付使用后，房屋主体结构质量经核验确属不合格，买受人请求解除合同和赔偿损失的，应予支持。《商品房买卖解释》第13条第1款规定：因房屋质量问题严重影响正常居住使用，买受人请求解除合同和赔偿损失的，应予支持。
4、商品房面积短少的责任承担。依照《商品房买卖解释》第14条的规定，如果双方当事人未有约定，对于依据计算房款的面积误差超过3%部分，费用由出卖人承担：即超过部分，买受人无需另行支付费用，不足部分，则由出卖人双倍返还买受人。这样处理，是将出卖人交付面积误差超过3%的房屋视为瑕疵给付。这样规定，一方面能促使出卖人规范开发、销售楼盘，另一方面给买受人比行使解除权获得更多的优惠，通过经济手段来促使合同有效，避免出现房地产逆向流转的后果。
5、关于房屋朝向、间距、位置不符合约定或规定的违约责任承担。对于景观房而言，如果房屋朝向、间距、位置的误差直接导致观看风景遭受严重影响，都使买受人赢利的合同目的受到极大损害，买受人可以行使解约权。对于一般商品房而言如果朝向、间距、位置位置的改变导致日照、通光受到严重影响的，买受人可以行使节约权。
6、关于绿化、配套设施以及装潢不符合约定或规定的责任承担。出卖人为吸引买受人，在预售时都会对绿化率、配套设施等作出承诺，但许多出卖人在交付房屋时，往往不能兑现允诺。一般认为，这些违约并不导致生命财产遭受危险，也不严重影响生活质量，因此不能认定为根本性违约，不应行使解除权，买受人可以就此主张违约金或赔偿损失。