交通事故，甲主要责任，乙次责任，保险公司应如何赔偿？

1、第一种是机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故;　　机动车与非机动车驾驶人、行人发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。对超过责任限额的部分，由机动车一方承担责任;但是，有证据证明非机动车驾驶人、行人违反道路交通安全法律、法规，机动车驾驶人已经采取必要处置措施的，机动车一方按照以下规定承担赔偿责任：　　机动车一方在交通事故中负主要责任的，承担80%的赔偿责任;　　　　交通事故的损失是由非机动车驾驶人、行人故意造成的，机动车一方不承担责任。　　　　未参加机动车第三者责任强制保险的，由机动车方在该车应当投保的最低保险责任限额内予以赔偿，对超过最低保险责任限额的部分，按照第一款的规定赔偿。　　第二种是机动车与机动车之间发生交通事故。　　机动车与机动车之间发生交通事故，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。超过责任限额的部分，负主要责任的，承担70%的赔偿责任;

发生交通事故后，保险公司接到报案后，应该派人到现场勘察或到交通部门了解出险情况，同时对车辆进行定损，估算合理费用，并通知车主到保险公司指定的修理厂处理事故车辆。对第三者责任的索赔，还应由保险公司对赔偿金额依法确定，并依据投保金额予以赔付。
对于保户与第三者私下谈定的赔偿金额，保险公司可拒绝赔付。

首先由法院认定赔偿数额，其次先由你投保的保险公司在保险限额内赔偿，最后不足的部分由你自己承担。具体情况根据交警的责任划分处理。