我公司在一经济诉讼中胜诉，在申请执行时，遭遇地方政府保护，不予强制执行，该怎么办？

你好，在民间借贷的有关案件中，申请发生法律效力的民事判决、裁定以及刑事判决、裁定，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院立案庭申请执行，也可以由审判员移送执行员执行。
申请强制执行的期限是判决生效后二年内，可以中止、中断。法院收到您的申请后六个月内进行执行。（对依法设立的仲裁机构的裁决，一方当事人不履行的，对方当事人可以向有管辖权的人民法院申请执行。
受申请的人民法院应当执行。）

申请执行应当以书面形式提出，应写明当事人基本情况、申请执行的依据、理由及事项，裁判文书主要内容、请求执行的数额，即执行标的，并附有核对无异的生效裁判文书的复印件。我国仲裁机构作出的仲裁裁决或调解应附有生效依据，送达回证及证明文书。
　　公民个人申请执行的，应当提供核对无异的本人身份证复印件；无身份证的应提交户口簿或公安机关出具的身份证明材料；企业法人申请执行的，应当提交企业法人营业执照复印件和法定代表人身份证明；机关或事业单位申请的，应提交法人代码证和法定代表人身份证明书。
　　申请执行仲裁机构的仲裁裁决，应当提交有仲裁条款的合同书或仲裁协议书。委托他人代为申请执行的，应当提交授权委托书，写明委托事项和代理人的权限。继承人或权利继受人申请执行的，应当提交继承或继受权利的证明文件。
　　国外一方当事人申请执行的，应当提交中文申请执行文书，当事人所在国与我国缔结或共同参加的司法协助条约有特别规定的，按照条约规定办理。　　申请执行人有义务向人民法院提供被执行人的详细情况和财产线索。
　　申请执行书的一般格式是开头写明申请人和被申请人的名称、地址，如果是法人的，要写明法定代表人，其职务、住址、电话。　　主文写明，双方因何案被哪个法院第多少号判决书或调解书，判决或调解后，现判决书或调解书已发生法律效力，但被申请人未全部履行判决书，或调解书中规定应尽的义务，根据《中华人民共和国民事诉讼法》有关规定，特向该法院申请予以执行。
然后写明申请执行事项。最后，附判决书，或调解书。

向二审法院申请执行。根据《民事诉讼法》的规定，发生法律效力的民事判决，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行。人民法院自收到申请执行书之日起超过六个月未执行的，申请执行人可以向上一级人民法院申请执行。

《民事诉讼法》
第二百二十六条　人民法院自收到申请执行书之日起超过六个月未执行的，申请执行人可以向上一级人民法院申请执行。上一级人民法院经审查，可以责令原人民法院在一定期限内执行，也可以决定由本院执行或者指令其他人民法院执行。

第二百三十六条发生法律效力的民事判决、裁定，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行，也可以由审判员移送执行员执行。
调解书和其他应当由人民法院执行的法律文书，当事人必须履行。
一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行。