由兄弟两人先成立了有限责任公司，兄长为法人，同时兄长为原国业的总公司分公司的负责人，国企改制后，兄长将原国企的人员算给员工的股份（约）17000元（不是现金）和人员带入公司，章程未修改，现公司亏损怎样退还这部分股份

首先，你要到成立分公司所在地的工商局领表。
然后再准备好以下材料：营业执照副本复印件、总公司章程复印件、分公司经营场所证明（租的要有租赁协议，自己的要有产权证明）、任职文件（总公司任命谁为分公司负责人）。
注意：有的需要盖总公司公章、分公司负责人的身份证复印件。
因为不知道你什么地方成立。所以您最好领表的时候 问清楚需要什么材料，这样就可以省很多事。

法人代表不是只能是营业执照上的负责人.n法定代表人指依法律或法人章程规定代表法人行使职权的负责人。我国法律实行单一法定代表人制，一般认为法人的正职行政负责人为其惟一法定代表人。
如公司为董事长或执行董事或经理（《公司法》第13条），而证券交易所的法定代表人为总经理（《证券法》第107条）。全民所有制工业企业的法定代表人为厂长或经理。

分公司负责人在法律上一般不对外承担责任，只是相当于总公司一个部门。
分公司是企业主体形式中一个特别的存在，其虽无独立法人资格，但是对外却往往有独立经营资格，须领取营业执照方可对外经营，而分公司的负责人，相应亦是属于法定登记的内容，但由于现行公司法对分公司负责人的法律地位及具体权利义务并无具体规定，导致实务中对于分公司负责人的具体权限及相关问题，难以有明确法律指引。
《公司登记管理条例》第四十五条的规定，分公司是指公司在其住所以外设立的从事经营活动的机构。分公司的登记事项包括：名称、营业场所、负责人、经营范围。相对于总公司而言，分公司在法律地位上相当于公司的一个职能部门，分公司的负责人则相当于部门经理。
《公司登记管理条例》规定，分公司不具有企业法人资格。分公司的经营范围一般不得超过总公司的经营范围。故法律上，分公司的负责人的权限亦受总公司的章程的约束，负责人亦需要遵守公司治理结构如股东会、董事会的决议。
由于分公司在法律地位上，相当于总公司的一个职能部门，因此总公司以其自身名义授权分公司中非负责人作为签约代表，并无不可。但是，由于被授权的分公司员工不是法定的代表人，可能会带来如下法律风险：

1、签约权限冲突的风险。
由于分公司负责人在法律上有对外代表分公司进行签约的权利，分公司负责人的签字一般亦对分公司具有约束力。因此，若总公司将签约权授予非负责人的其他员工，则需要明确约束或者禁止分公司负责人的签约权，但此类约束只能在公司内部生效，对外不能对抗签约相对方。
2、表见代理的风险。《合同法》第49条的规定，“行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后以被代理人名义订立合同，相对人有理由相信行为人有代理权的，该代理行为有效。
”若总公司将签约权授予非分公司负责人的其他员工，但该员工被终止代理权甚至与公司终止劳动关系后，总公司未及时告知交易相对方其无代理权的情况，该员工与交易方所签合同仍然成立并有效。