我与一家乡镇医院发生纠纷，99年我与该医院签订协议，医院出钱培养我，毕业后到该院工作终身不得调出，医院出了一年多的钱就不在出了，以后都是自费的并保留发票。毕业后到该院工作，07年发生纠纷，通过法律调节解决了纠纷，协议的一切票据都作废了，2012年我找到一张欠条，上面是这样写的：“医院为了盖门诊大楼向我借款5000元”，有医院的财务章。我并没有拿5000元的现金给他，这5000元是从上学自费的发票转的，我还能不能要回这些钱？

情况
一、借款通过银行转账支付。此种情况下出借人凭银行的转账凭证或银行流水记录等就可向出借人要求偿还借款。因为转账记录等可以证实出借人已向借款人支付了款项。人民法院在面对此种情况时，会要求借款人进行举证和说明，如借款人不能证明该笔款项作出合理解释，则法院会认定此笔借款已真实发生。
情况
二、借款通过现金支付，借款人向出借人出具了收到条。此种情况下借款人向出借人出具收到条，应该认为出借人已将款项支付给借款人。人民法院在面对此种情况时，处理思路和上面情况类似，会要求借款人进行举证和说明，如借款人不能证明该笔款项作出合理解释，则法院会认定此笔借款已真实发生。
情况
三、借款通过现金支付，借款人未向出借人出具收到条。此种情况下，出借人难以通过书面证据直接证明自己已将款项支付给借款人。出现此种情形，如若借款人抵赖，出借人再向借款人讨回借款，难度便比较大了。人民法院在面对此种情况时，如若双方都不能进一步的举证，人民法院就难以认定事实，一般会作出驳回起诉的裁定。

欠条本身是没有有效期之说的。法律规定的诉讼时效，从知道或者应当知道权利被侵害之日算起。只有欠条约定了还款期限，自还款期限届满之日起两年内都可以起诉；如果没有约定还款期限，不受诉讼时效的限制。
如果能够证明曾经向债务人催讨债权，自催讨之日起诉讼时效中断。
　　附《民法通则》相关规定： 　　
第一百三十五条 向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为二年，法律另有规定的除外。
　　
第一百三十七条 诉讼时效期间从知道或者应当知道权利被侵害时起计算。但是，从权利被侵害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。有特殊情况的，人民法院可以延长诉讼时效期间。

当事人可通过提起民事诉讼的方式维权，请求法院判令对方承担相应的给付责任。
一、当事人起诉，首先应提交起诉书，并按对方当事人人数提交相应份数的副本。当事人是公民的，应写明双方当事人的姓名、性别、年龄、籍贯、住址;当事人是单位的，应写明单位名称、地址、法定代表人或负责人姓名。起诉书正文应写明请求事项和起诉事实、理由，尾部须署名或盖公章。　　
二、根据"谁主张谁举证"原则，原告向法院起诉应提交下列材料：　　
1、原告主体资格的材料。如居民身份证、户口本、护照、港澳同胞回乡证、结婚证等证据的原件和复印件;企业单位作为原告的应提交营业执照、商业登记证明等材料的复印件。　　
2、证明原告诉讼主张的证据。如合同、协议、债权文书(借条、欠条等)、收发货凭证、往来信函等。　　
三、当事人向法院提交书证，应填写一式两份证据清单，详细列明提交证据的名称、页数。证据经法院承办人核对后，由承办人在证据清单上签字盖章，一份交当事人，一份备案。　　
四、立案庭在当事人履行必须的手续和交齐有关证据材料之后，在七天内，对符合立案条件的，办理立案手续;对不符合立案条件的，依法裁定不予受理。　　
五、当事人应在收到受理通知书之日起七天内预交案件受理费和其他诉讼费用，如确有困难，可在预交期内向本院提出减、缓、免交的书面申请，逾期不交或者书面申请缓、减、免交未获批准而仍不预交的，本院将裁定按自动撤诉处理。　　
六、立案手续后，案件由法院排期开庭，当事人应服从法院的各项工作安排，并于结案后到财务室结算诉讼费用，多退少补。