我单位是差额补助的事业单位，已于多年前参加了社保，最近发现单位在为职工上缴社会保险时，是按扣除了单位代缴的各项社保、工伤、失业医疗以及个人所得税后的实发工资作为基数上报缴费基数的。

个人所得税的税率：
　　
一、工资、薪金所得，适用超额累进税率，税率为百分之三至百分之四十五（税率表附后）。
　　
二、个体工商户的生产、经营所得和对企事业单位的承包经营、承租经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）。
　　
三、稿酬所得，适用比例税率，税率为百分之二十，并按应纳税额减征百分之三十。
　　
四、劳务报酬所得，适用比例税率，税率为百分之二十。对劳务报酬所得一次收入畸高的，可以实行加成征收，具体办法由国务院规定。
　　
五、特许权使用费所得，利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得，偶然所得和其他所得，适用比例税率，税率为百分之二十。

个人所得税是我国法定的税种之一，针对收入进行收税，符合征税标准的个人都应当缴纳，
一、对个人转让住房，不能够提供购房原值发票或合理费用(指住房装修费用、住房贷款利息等)的合法有效凭证，致使不能够准确计算应纳税所得额的，采取核定征收方式征收个人所得税，核定征收率仍为1%。
二、对个人转让住房，能够提供购房原值发票或合理费用(指住房装修费用、住房贷款利息等)的合法有效凭证的，按其售房收入减去购房原值和合理费用后的余额为应纳税所得额按20%征收个人所得税。”

治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金全额支付；不符合规定标准的，谁同意使用谁支付。
《工伤保险条例》
第三十条　职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。
职工治疗工伤应当在签订服务协议的医疗机构就医，情况紧急时可以先到就近的医疗机构急救。
治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。
工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准，由国务院社会保险行政部门会同国务院卫生行政部门、食品药品监督管理部门等部门规定。
职工住院治疗工伤的伙食补助费，以及经医疗机构出具证明，报经办机构同意，工伤职工到统筹地区以外就医所需的交通、食宿费用从工伤保险基金支付，基金支付的具体标准由统筹地区人民政府规定。
工伤职工治疗非工伤引发的疾病，不享受工伤医疗待遇，按照基本医疗保险办法处理。
工伤职工到签订服务协议的医疗机构进行工伤康复的费用，符合规定的，从工伤保险基金支付。