两个人不是一个户口所在地，在女方户口所在地登记结婚，后续会有那些问题？以及将来孩子入户口会有怎样的麻烦？

没结婚登记，出生后孩子上户口，孩子的母亲可持子女的出生医学证明、本人身份证、户口簿等，到户口所在地派出所申请办理孩子的出生登记。 　　没结婚登记，出生后孩子怎么上户口。
　　没有结婚登记生的子女属于非婚生子女，非婚生子女如果随母报户口，孩子的母亲可持子女的出生医学证明、本人身份证、户口簿等，到户口所在地派出所申请办理孩子的出生登记。
如果无出生医学证明，孩子的母亲要持派出所出具的亲子鉴定证明，到相关司法部门做亲子鉴定，然后持亲子鉴定书，到派出所申请办理出生登记。 　　因为非婚生子女并不符合生育政策要求，因此应当根据国务院和各个地方的法规规定来办理登记非婚生子女的户口，并且缴纳社会抚养费。
　　另外，在需要生育证的地区，父母要先到户口所在地的街道计生办缴纳一定数额的社会抚养费(计划外生育罚款)、落实计划生育措施；之后才可以凭计生部门开出的证明到公安机关上户口。
　　因此非婚生子女在完成相应的手续，上完户口后，就可以享受和婚生子同样的权利，成为社会真正的一员的。