请问，分居已有三年了，如果对方不同意意离婚，起诉离婚能离吗？

在我国，离婚的方式有两种，一种是登记离婚，另一种是诉讼离婚。
一、依照我国《婚姻法》第31条的规定，男女双方自愿离婚并且对子女的抚养及对财产的分割问题作出的适当的处理的，可以到婚姻登记机关进行登记离婚，不须进行诉讼。
登记离婚时，要提供以下文件：
1、户口本、身份证
2、结婚证
3、双方共同签署的离婚协议。
建议你首先尽量说服他，和他进行登记离婚，尽量以和平的方式解决离婚问题。
如果他实在不想离婚，而你坚持一定要离，那么，就只有进行离婚诉讼了。

【1】根据《婚姻法》第32条，
第三十二条　男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：
（一）重婚或有配偶者与他人同居的
（二）实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改的
（四）因感情不和分居满二年的
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
【2】因为感情不和，分居两年起诉离婚，是其中的一个情形，关键是夫妻感情是否破裂。
没有分居两年，有其他任何一种情形，都可以夫妻一方去起诉离婚的。

第一，协议离婚不成，只能诉讼离婚，你可以感情不和，起诉到法院请求解除婚姻关系。如果有证据证明夫妻感情实质破裂，比如连续分居两年，法院会判决离婚。 第二，建议向律师寻求一个较为详尽的咨询，这些咨询包括双方婚姻状况、财产情况、债务情况、子女情况，律师的咨询会根据你的案情和婚姻纠纷的具体情况进行分析，并给予一个总括性的指导意见，便于后期操作。
第三，如果同时起诉要求财产分割的，要保存好有效的证件、财产凭证等。包括：结婚证、购房协议或房产证、车辆买卖合同、发票、存折存单、借条、股票帐户、贵重财产发票。即使拿不到原件，也应当保存复印件留做底案，帐户号均要详细作记录。
第四，关于孩子，因为两周岁以上了，如果主张扶养，法院根据对孩子成长最有利原则判给一方，并且对方应当支付抚养费的，根据《婚姻法》第三十七条规定：离婚后，一方抚养子女，另一方应负担必要的生活费和教育费的一部或全部。
因此，如果孩子由你扶养，对方应当支付抚养费。不直接抚养子女的一方给付子女的抚养费的具体数额，可由双方协商确定，协商不成的，可依据子女的实际需要、父母双方的负担能力和当地的实际生活水平确定，有固定收入的，抚育费一般可按其月总收入的 20％至30％的比例给付，负担两个子女的可适当提高，但最高一般不超过月总收入的50％。
无固定收入的，可依据当年总收入或同行业平均收入比照前面的比例计算。如果要争取孩子抚养权，需要进行充分的证据收集来证明自己扶养更加有利于孩子成长。 第五，离婚起诉涉及到证据收集、诉讼策略的制定以及具体的立案、庭审、质证程序，特别需要注意好证据的收集，建议你寻求律师协助，若你需要，欢迎来电详询。