请问，农村自建商品房买卖，没有房产证有土地证可以公正吗，签订土地转让协议有效吗？

没有产权证就等于没有所有权，所有的不当风险都是从这一点出来的；在期房买卖中，更大的问题是??暂时谁都没有所有权。由于这两个特性，风险是无法完全消除的；说宽泛一点，任何交易都无法消除全部风险。
这种情况下主要的风险是：一房二卖；不履行合同义务：无法交房、按时交房、质量瑕疵等。还有一些更大的风险就已经不属于需要讨论的范畴了。
但是必须要考虑到，期房买卖是中国的实践现实（虽然已经在逐渐改变）；大部分先例是成功的。
因此买卖是可行的，要注意风险防范。从法律层面来说，没有所有权和占有，就无法通过物权的保障机制来防范；只能通过你和开放商之间的合同关系所构建的债权关系来寻求保障。因此，合同是关键。
为了规避风险，建议合同中将可能出现的情况想清楚，并提前规定好合适数额的违约金。这样可以避免未来争议中举证的麻烦，也可以激励债务人、产生更大的债的保证的作用。但考虑到开放商往往有格式合同，建议仔细阅读；对于你不同意的责任划分、责任数额可以想办法商量。
提一个几乎不可能的情况，如果开发商通过某种形式提供了担保，那也是更好的规避风险方法。

农村宅基地使用权可以转让，但必须具备以下农村宅基地转让程序的条件：一是经本村委会同意;二是转让人与受让人为同村人;三是转让人户口已迁出本村或“一户多宅或多房”。如系一户一宅，须明确表示不再申请宅基地，且有证据表明其已有住房保障，如与其他近亲属合户居住;四是受让人无宅基地;五是宅基地使用权不能单独转让，须与住房一并转让。

对于农村集体土地转让是否可行这一问题的解释是可以转让，但是不能自由转让，主要受到以下几点的制约： 仅能转让给本集体成员。 不可以转让用于非农业建设。 土地管理法 第二条　中华人民共和国实行土地的社会主义公有制，即全民所有制和劳动群众集体所有制。
　　全民所有，即国家所有土地的所有权由国务院代表国家行使。 　　任何单位和个人不得侵占、买卖或者以其他形式非法转让土地。土地使用权可以依法转让。 　　国家为了公共利益的需要，可以依法对土地实行征收或者征用并给予补偿。
　　国家依法实行国有土地有偿使用制度。但是，国家在法律规定的范围内划拨国有土地使用权的除外。 第六十三条　农民集体所有的土地的使用权不得出让、转让或者出租用于非农业建设；但是，符合土地利用总体规划并依法取得建设用地的企业，因破产、兼并等情形致使土地使用权依法发生转移的除外。