公司以发放全额工资为由 把生育保险的生育津贴扣除 是否合法？

因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

生育妇女缴纳社会保险费累计满一年的，其生育生活津贴按下列办法计发：　　
(一)从业妇女，按本人生产或流产当月的城镇养老保险费缴费基数乘以本人按规定享受的生育生活津贴期限计发。个体工商户及其帮工、自由职业者的月生育生活津贴标准最高不超过本市上年度职工月平均工资。从业妇女，其生产或者流产当月领取的生育生活津贴，因本人上一年度月平均工资收入高于全市职工月平均工资300%，超过部分不计入缴费基数而不足其缴费年度工资收入的，不足部分应当由单位发放。　　
(二)在领取失业保险金期限内的失业妇女，按经失业保险经办机构核准的本人生产或流产当月的失业保险金标准乘以本人按规定享受的生育生活津贴期限计发。超过失业保险金领取期限的失业妇女，按本人生产或流产当月的本市同类人员的失业保险金标准乘以本人按规定享受的生育生活津贴期限计发。　　生育妇女缴纳社会保险费累计不满一年的，其生育生活津贴按下列办法计发：　　
(一)从业妇女，按本人生产或流产当月本市企业职工月最低工资标准乘以本人按规定享受的生育生活津贴期限计发。　　
(二)在领取失业补助金期限内的失业妇女，按经失业保险经办机构核准的本人生产或流产当月的失业补助金标准乘以本人按规定享受的生育生活津贴期限计发。超过失业保险金领取期限或者暂停领取失业保险金以及符合领取失业保险金条件但未领取过失业保险金的失业妇女，按经失业保险经办机构核准的本人生产或流产当月的本市同类人员的失业保险金标准乘以本人按规定享受的生育生活津贴期限计发。

生育津贴的领取金额=分娩当月单位平均缴纳工资基数÷30×产假天数；
缴纳工资基数指的社保的缴纳基数，即五险一金的扣除基数。社保缴纳基数是按照上一个社保年度的所有工资收入的月平均值计算的，也就是上一个年度的平均工资，包括年终奖、津贴、奖金等。
北京市的社保年度为当年的7月至下一年的6月。
举例说明：你所在地区的产假天数为128天，刚顺产一个宝宝，单位员工的上一社保年度月平均工资为8000元，你上一社保年度月工资是1万元，则你能领取的生育津贴金额为：8000÷30×128=34133元，这部分由社保基金支付。
由于你的工资高于单位员工的平均工资，因此超出的部分2000÷30×128=8533元由单位支付，总共领取的生育津贴金额为42666元。
需要注意的是，生育津贴是不扣个人所得税的。