医疗事故赔偿的方式:由医疗机构按照双方协商确认的赔偿数额进行赔偿。且赔偿数额一般以医疗事故等级、医疗机构过失程度、损害程度、医疗事故损害后果与患者原有疾病状况之间的关系等方面综合确认。法律依据:《
医疗事故处理条例》第四十八条已确定为医疗事故的,卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求,可以进行医疗事故赔偿调解。调解时,应当遵循当事人双方
自愿原则,并应当依据本条例的规定计算赔偿数额。第四十九条医疗事故赔偿,应当考虑下列因素,确定具体赔偿数额:
(一)医疗事故等级;
(二)医疗过失行为在医疗事故损害后果中的责任程度;
(三)医疗事故损害后果与患者原有疾病状况之间的关系。不属于医疗事故的,医疗机构不承担赔偿责任。