处理商标注册人撤诉的方式是:如果法院准许撤诉的,则原告起诉时提出的诉讼请求就不能得到法院的支持;如果法院不予准许的,原告经传票传唤无正当理由拒不到庭的,法院可以缺席判决。法律依据:《
中华人民共和国民事诉讼法》第一百四十七条
被告经传票传唤,无正当理由拒不到庭的,或者未经法庭许可中途退庭的,可以缺席判决。
第一百四十八条
宣判前,原告申请撤诉的,是否准许,由人民法院裁定。人民法院裁定不准许撤诉的,原告经传票传唤,无正当理由拒不到庭的,可以缺席判决。
第一百五十二条
人民法院适用普通程序审理的案件,应当在立案之日起六个月内审结。
有特殊情况需要延长的,由本院院长批准,可以延长六个月;还需要延长的,报请上级人民法院批准。