请问一下，双方不是上海户口所在地，双方持有户口本，可以在上海登记结婚？

根据我国法律规定不允许登记结婚的情况包括：

一、不是男女双方申请的结婚登记
　　我国《婚姻法》明文规定，结婚登记必须是男女双方自愿到婚姻登记机关进行登记。
　　
二、已经结婚的人不得再次办理结婚登记
　　一夫一妻是我国基本的婚姻制度。申请办理结婚登记的必须是在我国婚姻登记状况上是未婚的，已经进行过结婚登记，和其他人有合法的夫妻关系的，不允许再次申请结婚登记。再婚必须是在前段婚姻关系依法终止以后，就是说要有合法有效的离婚证、或者法院的生效裁判文书。有配偶者又与他人结婚，是会触犯重婚罪的。
　　
三、近亲不得结婚
　　我国法律规定有，直系血亲以及三代以内旁系血亲禁止结婚。。
　　
四、患有医学上认为不应当结婚的疾病
　　患有医学上认为不应当结婚的疾病，是指精神方面的疾病和重大不治的传染性疾病或者是遗传性疾病。但是现在婚前强制医疗被取消了，可能会难以保证。
　　
五、未达到法定的结婚年龄不得结婚
　　我国《婚姻法》规定了男女的最低结婚年龄，男不得早于22周岁，女不得早于20周岁。鼓励提倡晚婚晚育。结婚登记须达到法定婚龄，是强制性的法律规定，未达法定婚龄就是绝对不符合结婚的条件，婚姻登记机关有权，并且必须拒绝为其登记。而晚婚晚育只是提倡，不具有法律强制性。