由于学生扫地不干净，公立学校校长扣教师绩效工资合法吗？

扣教师绩效工资不合法。绩效工资是根据完成的数量和质量作为达标的要求，两者符合自然奖励，反之则扣除，是有一定标准的，不能够随意定制。企业用人单位可以根据绩效考评给予劳动者奖励或者扣除工资，但是不能随意扣除和随意奖励。
扣绩效工资时公司应该与员工进行协商，协商不成，收集证据，申请劳动仲裁部门直接提出仲裁，要求用人单位支付所扣的工资。如果当事人不满仲裁结果，可以通过起诉解决。相关法律规定，劳动合同、集体合同均未约定的，可由用人单位与职工代表通过工资集体协商确定，协商结果应签订工资集体协议。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》
第七十八条
解决劳动争议，应当根据合法、公正、及时处理的原则，依法维护劳动争议当事人的合法权益。
第七十九条

劳动争议发生后，当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解；调解不成，当事人一方要求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
当事人一方也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
第八十条

在用人单位内，可以设立劳动争议调解委员会。劳动争议调解委员会由职工代表、用人单位代表和工会代表组成。
劳动争议调解委员会主任由工会代表担任。

员工工作原因全部扣除绩效工资是合理合规的。绩效工资是奖金的另一种称呼，是指单位在基本工资之外额外支付的工资，用人单位拖欠工资的，劳动者可以向劳动监察部门投诉或者向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
投诉时，应提供本人身份证复印件以及相关拖欠工资的证据。且经责令后仍不支付的，劳动者可以要求用人单位支付赔偿金。法律依据：《中华人民共和国教师法》
第二十五条 教师的平均工资水平应当不低于或者高于国家公务员的平均工资水平，并逐步提高。
建立正常晋级增薪制度，具体办法由国务院规定。
第二十六条 中小学教师和职业学校教师享受教龄津贴和其他津贴，具体办法由国务院教育行政部门会同有关部门制定。
第三十八条 地方人民政府对违反本法规定，拖欠教师工资或者侵犯教师其他合法权益的，应当责令其限期改正。
违反国家财政制度、财务制度，挪用国家财政用于教育的经费，严重妨碍教育教学工作，拖欠教师工资，损害教师合法权益的，由上级机关责令限期归还被挪用的经费，并对直接责任人员给予行政处分；情节严重，构成犯罪的，依法追究刑事责任。

法律分析：员工工作原因全部扣除绩效工资是合理合规的。绩效工资是奖金的另一种称呼，是指单位在基本工资之外额外支付的工资，用人单位拖欠工资的，劳动者可以向劳动监察部门投诉或者向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
投诉时，应提供本人身份证复印件以及相关拖欠工资的证据。且经责令后仍不支付的，劳动者可以要求用人单位支付赔偿金。法律依据：《中华人民共和国教师法》
第二十五条 教师的平均工资水平应当不低于或者高于国家公务员的平均工资水平，并逐步提高。
建立正常晋级增薪制度，具体办法由国务院规定。
第二十六条 中小学教师和职业学校教师享受教龄津贴和其他津贴，具体办法由国务院教育行政部门会同有关部门制定。
第三十八条 地方人民政府对违反本法规定，拖欠教师工资或者侵犯教师其他合法权益的，应当责令其限期改正。
违反国家财政制度、财务制度，挪用国家财政用于教育的经费，严重妨碍教育教学工作，拖欠教师工资，损害教师合法权益的，由上级机关责令限期归还被挪用的经费，并对直接责任人员给予行政处分；情节严重，构成犯罪的，依法追究刑事责任。