甲方出资委托乙方定制开发一套软件，其中知识产权为双方共有，但事后乙方在没有通知甲方的情况下私自注册了这套软件的版权，这样甲方是否可以上诉法院，要求乙方赔偿。

版权注册：
1、办理部门：　　申请人办理作品著作权登记申请，可来人到CPCC版权登记大厅办理，或通过邮寄方式向中国版权保护中心著作权登记部提交登记申请材料办理。　　中国版权保护中心著作权登记部负责办理文字作品、口述作品、音乐、戏剧、曲艺、舞蹈、杂技艺术作品、美术、建筑作品、摄影作品、电影作品和以类似摄制电影的方法创作的作品、工程设计图、产品设计图、地图、示意图等图形作品和模型作品、法律、行政法规规定的其它作品著作权登记工作。　　　　
2、材料要求：　　申请作品著作权登记应当提交的材料及要求：　　
（1）按要求填写完整的作品著作权登记申请表；　　
（2）申请人的身份证明；　　
（3）权利归属证明；　　
（4）作品的样本（可以提交纸介质或者电子介质作品样本）；　　
（5）作品说明书（请从创作意图、创作过程、独创性三方面写，并作者签字）；　　
（6）委托他人代为申请时，代理人应提交申请人的授权书；　　
（7）代理人的身份证明。　　
3、办理步骤：　　申请人提交登记申请材料--登记机构核查接收材料—通知缴费—申请人缴纳登记费用—登记机构受理申请—审查—制作发放登记证书—公告。　　
4、办理时限：　　登记机构受理登记申请后30个工作日办理完成。需要补正材料的，申请人自接到补正通知书后两个月内完成补正，登记机构自收到符合要求的补正材料后30个工作日办理完成。　　
5、缴费要求：　　申请人办理作品著作权登记申请应按规定缴纳费用。　　申请人收到缴费通知书后，应于10日内直接到CPCC版权登记大厅向中国版权保护中心财务处缴费，或通过银行。汇付登记费用的，应在汇单中写明作品名称、申请流水号。　　　　
6、查询服务：　　申请人可以通过网站了解登记申请的办理情况，或与受理通知书上写明的承办人联系询问登记办理情况。　　作品登记申请人、其他社会公众、司法机关、行政管理机关等对已登记的作品可以申请查询相关信息。

知识产权出资是指知识产权所有人将能够依法转让的知识产权专有权或者使用权作价，投入标的公司以获得股东资格的一种出资方式。　　《公司法》、《中外合资经营企业法》都明确规定知识产权的出资范围为工业产权和非专利技术(也称专有技术)。在我国，工业产权包括专利权和商标权这两类权利。因而，应注意到知识产权出资标的中不包括著作权。另外，外商投资企业法律中还要求，作为外国合营者出资的工业产权或专有技术必须符合下列条件之一：　　
(1)能生产中国急需的新产品或出口适销产品的;　　
(2)能显著改进现有产品的性能、质量，提高生产效率的;　　
(3)能显著节约原材料、燃料、动力的。

如何申请知识产权保护首先，通过知识产权的行政保护途径。（l）专利权的行政保护：主管机关为国家知识产权局和地方知识产权行政管理部门，负责对专利纠纷进行行政调处。专利纠纷主要包括：专利侵权纠纷、专利权属纠纷等。知识产权管理机关受理专利纠纷案件的条件如下：调处请求人必须是与纠纷和争议有直接利害关系的单位或个人；有明确的被请求人；有具体要求和事实依据；属于知识产权管理机关管辖范围和受案范围；当事人尚未向人民法院起诉。
（2）商标权的行政保护：主管机关为侵权行为地的县级以上工商行政管理部门，负责对侵犯商标权的行为进行行政处罚。
（3）著作权的行政保护：主管机关为国家版权局和地方著作权行政管理部门，负责对侵犯著作权的行为进行行政处罚。 其次，通过知识产权的司法保护途径。
（1）管辖权的确定：因案件性质不同，分别由具有管辖权的法院及侵权行为地人民法院或被告住所地人民法院管辖。
（2）提起知识产权侵权诉讼应满足的条件：原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；有明确的被告；有具体的诉讼请求和事实、理由；属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。